More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0544 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  100 
 
 		 395 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  75.7 
 
 		 395 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  73.92 
 
 		 395 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  75.44 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  74.68 
 
 		 393 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  50.52 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  48.97 
 
 		 400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0245  Serine-pyruvate aminotransferase/aspartate aminotransferase  48.97 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  44.19 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  43.94 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  45.14 
 
 		 404 aa  325  8.000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  46.91 
 
 		 418 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  40.76 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  41.88 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  41.01 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  40.1 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  42.97 
 
 		 391 aa  295  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  40.81 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  42.71 
 
 		 391 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  40.46 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0729  aminotransferase, class V  44.01 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.434547  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  41.03 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  39.9 
 
 		 399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  38.34 
 
 		 422 aa  289  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  41.94 
 
 		 391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  39.79 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  41.24 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  39.49 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  39.07 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  41.39 
 
 		 397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  41.13 
 
 		 397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  38.13 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  40.51 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  39.39 
 
 		 400 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  39.25 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  38.5 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  37.79 
 
 		 394 aa  272  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  38 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  37.84 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  38.34 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  37.76 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  38.2 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  38.23 
 
 		 417 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  39.95 
 
 		 421 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  37.97 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  36.81 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  37.22 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  40.21 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  36.89 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  38.14 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  36.84 
 
 		 396 aa  242  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  37.47 
 
 		 400 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  35.54 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  36.58 
 
 		 415 aa  235  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  34.51 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  35.15 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  35.15 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  32.63 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  34.07 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  35.89 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  34.68 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  35.05 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  33.61 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  33.42 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  34.94 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  31.61 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  36.54 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.79 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.66 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  35.17 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  34.07 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  33.52 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.75 
 
 		 384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  35.22 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  34.42 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.69 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  30.75 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  31.43 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  33.87 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  31.51 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.25 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  32.15 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  31.99 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.24 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.01 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  31.17 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  34.59 
 
 		 385 aa  192  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  32.89 
 
 		 382 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  30 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  35.46 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  30.89 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  33.52 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.59 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  31.34 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  29.61 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  29.35 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  30.95 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>