More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1369 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 397 aa  801    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  53.12 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  49.87 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  50.39 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  48.1 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  49.62 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  50.52 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  48.06 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  48.08 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  49.74 
 
 		 406 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  47.33 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  47.55 
 
 		 401 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  48.35 
 
 		 406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  50.26 
 
 		 400 aa  352  7e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  47.8 
 
 		 398 aa  348  9e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  46.8 
 
 		 406 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  50 
 
 		 397 aa  345  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  49.48 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  47.4 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  48.47 
 
 		 391 aa  342  8e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  45.05 
 
 		 395 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  44.19 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  49.87 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  46.35 
 
 		 395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  47.7 
 
 		 391 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  49.47 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  47.45 
 
 		 391 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  45.01 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  43.23 
 
 		 395 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  47.41 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  45.29 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  46.21 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  45.64 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  43.47 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  43.26 
 
 		 414 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  45.95 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  45.61 
 
 		 402 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  42.01 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  45.61 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  46.1 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  46.74 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  45.71 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  42.89 
 
 		 393 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  43.12 
 
 		 391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  46.74 
 
 		 395 aa  306  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  43.12 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  45.78 
 
 		 415 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  43.27 
 
 		 398 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  43.12 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  42.33 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  45.58 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  44.29 
 
 		 396 aa  275  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  40.63 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  40.36 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  39.02 
 
 		 396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  39.27 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  39.27 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  39.95 
 
 		 418 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  40.26 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  40.26 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0245  Serine-pyruvate aminotransferase/aspartate aminotransferase  40.26 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0729  aminotransferase, class V  40.11 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.434547  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  36.99 
 
 		 384 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  36.18 
 
 		 383 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  38.29 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  38.46 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  36.99 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.83 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  37.93 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  34.07 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  34.07 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  37.33 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  36.76 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  34.78 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  35.97 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  34.95 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  32.97 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  33.88 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.06 
 
 		 385 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  35.97 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  33.79 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.54 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  37.13 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  33.7 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  33.52 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  34.16 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  33.61 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  33.52 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.98 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.33 
 
 		 382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  34.18 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  33.53 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.61 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  31.69 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  33.78 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.49 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  30.61 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  31.44 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  33.7 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  34.59 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>