More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3472 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  100 
 
 		 396 aa  813    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  56 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  58.52 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  57.36 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  56.33 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0245  Serine-pyruvate aminotransferase/aspartate aminotransferase  57.11 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  44.84 
 
 		 395 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0729  aminotransferase, class V  47.64 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.434547  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  45.59 
 
 		 395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  44.56 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  43.94 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  44.05 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  39.02 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  39.49 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  39.49 
 
 		 391 aa  252  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  39.74 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  37.28 
 
 		 401 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  38.27 
 
 		 402 aa  245  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  38.38 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  38.38 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  37.14 
 
 		 422 aa  242  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  37.76 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  38.58 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  36.27 
 
 		 398 aa  239  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  38.04 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  39.85 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  38.04 
 
 		 401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  39.59 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  37.76 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  37.22 
 
 		 414 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  35.37 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  36.97 
 
 		 396 aa  229  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  36.14 
 
 		 413 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  35.88 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  37.4 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  36.39 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  34.7 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  36.78 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  37.73 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  36.04 
 
 		 406 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  37.8 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  35.95 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  36.95 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  36.76 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  37.4 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  35.55 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  33.67 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  34.83 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  34.3 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  34.3 
 
 		 402 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  34.23 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  34.15 
 
 		 391 aa  200  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.19 
 
 		 382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.19 
 
 		 382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  32.16 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  33.51 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  35.67 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  33.59 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  32.28 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  33.6 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  33.88 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  34.72 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  31.12 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  33.15 
 
 		 382 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  35.29 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.33 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  28.65 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.24 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  28.91 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  31.02 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  31.94 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  29.22 
 
 		 382 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  30.57 
 
 		 386 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  30.61 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.08 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  26.15 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  30.59 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  32.18 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  29.22 
 
 		 360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  28.83 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  31.27 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  27.62 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  28.83 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  26.27 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  28.42 
 
 		 381 aa  150  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  29.79 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  27.88 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.22 
 
 		 362 aa  146  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  29.84 
 
 		 382 aa  146  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  25.47 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  25.88 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  31.67 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  29.72 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  31.94 
 
 		 362 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  29.47 
 
 		 385 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  29.26 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  29.49 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>