More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0245 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0245  Serine-pyruvate aminotransferase/aspartate aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  796    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  93.25 
 
 		 400 aa  726    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  99.5 
 
 		 400 aa  792    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  61.73 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  58.5 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  56.11 
 
 		 396 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0729  aminotransferase, class V  59.28 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.434547  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  49 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  47.84 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  49.37 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  48.12 
 
 		 395 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  46.29 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  40.36 
 
 		 397 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  40.36 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  40.1 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  40.2 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  40.15 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  38.35 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  39.85 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  38.83 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  38.85 
 
 		 401 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  37.94 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  38.12 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  36.25 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  37.81 
 
 		 398 aa  229  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  38.01 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  37.31 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  39.31 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  39.4 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  39.15 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  38.32 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  37.94 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  38.99 
 
 		 421 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  38.15 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  38.25 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  37.25 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  37.04 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  37.56 
 
 		 414 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  36.59 
 
 		 399 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  37.02 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  37.28 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  35.04 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  36.75 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  39.48 
 
 		 397 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  39.95 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  36.99 
 
 		 417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  36.75 
 
 		 402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  34.53 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  35.97 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  36.88 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  36.75 
 
 		 406 aa  209  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  35.67 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  35.18 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  35.01 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  35.82 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  33.5 
 
 		 396 aa  196  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  35.26 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  34.29 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  36.11 
 
 		 395 aa  193  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  37.12 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  34.39 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  33.69 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  33.69 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31.13 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  34.94 
 
 		 388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.03 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  36.27 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  33.87 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  30.03 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  33.25 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  31.2 
 
 		 382 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  36.86 
 
 		 383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  34.18 
 
 		 382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  34.83 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.57 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  28.99 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.37 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.53 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.97 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  28.8 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  33.5 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  29.9 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  31.93 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  29.37 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  31.74 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  29.8 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  31.07 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  30.29 
 
 		 381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.93 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  27.5 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  32.12 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.07 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  30.6 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.4 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  30.79 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  28.04 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  34.57 
 
 		 363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  28.01 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  28.89 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  26.62 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>