More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04740 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL04740  protoheme IX farnesyltransferase, putative  100 
 
 		 484 aa  976    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35453  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47531  Heme A farnesyltransferase  40.26 
 
 		 452 aa  207  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695562  normal  0.861944 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01722  Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial Precursor (EC 2.5.1.-)(Heme O synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCK8]  34.2 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.69332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32550  predicted protein  36.84 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  36.75 
 
 		 363 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  33.11 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  33.91 
 
 		 300 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  30.5 
 
 		 310 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  31.11 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  29.79 
 
 		 305 aa  106  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  29.88 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  34.27 
 
 		 298 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  32.77 
 
 		 306 aa  101  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  34.27 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  29.63 
 
 		 296 aa  100  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  29.57 
 
 		 317 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 		 298 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  30.46 
 
 		 328 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  29.33 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  27.12 
 
 		 297 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  29.25 
 
 		 297 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  31.75 
 
 		 297 aa  97.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  29.57 
 
 		 300 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  27.27 
 
 		 323 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  26.94 
 
 		 323 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  31.2 
 
 		 323 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  32.04 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  30.16 
 
 		 300 aa  93.6  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  32.95 
 
 		 304 aa  93.6  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  28.9 
 
 		 313 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  28 
 
 		 297 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  27.65 
 
 		 301 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  27.65 
 
 		 301 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  30.5 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  30.82 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  28.62 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  27.65 
 
 		 301 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  28.06 
 
 		 310 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  27.65 
 
 		 301 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  27.74 
 
 		 300 aa  91.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  28.57 
 
 		 313 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  26.94 
 
 		 297 aa  91.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  27.53 
 
 		 303 aa  91.3  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  29.87 
 
 		 292 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  26.35 
 
 		 315 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  30 
 
 		 299 aa  90.5  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  27.78 
 
 		 534 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 312 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  28.03 
 
 		 301 aa  90.1  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  29.3 
 
 		 302 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  36.32 
 
 		 276 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  31.58 
 
 		 305 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  28.03 
 
 		 301 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  33.74 
 
 		 311 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  29.73 
 
 		 304 aa  89.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  29.32 
 
 		 312 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  31.2 
 
 		 622 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  30.6 
 
 		 302 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  28.99 
 
 		 301 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  29.32 
 
 		 315 aa  88.2  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  28.22 
 
 		 300 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  27.87 
 
 		 300 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  29.45 
 
 		 324 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  30.22 
 
 		 342 aa  87  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  27.24 
 
 		 305 aa  87  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  30.36 
 
 		 342 aa  87.4  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  27.87 
 
 		 300 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  28.28 
 
 		 298 aa  86.7  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  29.51 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  30.09 
 
 		 308 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  27.87 
 
 		 300 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  28.34 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  29.12 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  27.6 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  29.14 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  29.14 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  29.32 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  28.67 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  27.72 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  27.63 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  28.18 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  31.48 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  29.87 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  26.71 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  30.8 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  28.99 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1827  protoheme IX farnesyltransferase, putative  32.18 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000128435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  33.78 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  31.22 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  32.63 
 
 		 294 aa  83.2  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  28.53 
 
 		 353 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  32.13 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  27.24 
 
 		 312 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  29.47 
 
 		 304 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  27.85 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  27.24 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  29.57 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  29.9 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  29.57 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>