More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1827 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1827  protoheme IX farnesyltransferase, putative  100 
 
 
282 aa  553  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000128435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0532  UbiA prenyltransferase  42.37 
 
 
346 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1349  UbiA prenyltransferase  42.75 
 
 
287 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0253  UbiA prenyltransferase  42.79 
 
 
271 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0223  protoheme IX farnesyl transferase, putative  42.36 
 
 
270 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1537  UbiA prenyltransferase  44.07 
 
 
274 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  37.55 
 
 
326 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  31.14 
 
 
315 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 
300 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  34.55 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2530  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  39.34 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  31.53 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  32.76 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  32.24 
 
 
297 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0046  UbiA prenyltransferase  35.44 
 
 
272 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  36.45 
 
 
298 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  35.98 
 
 
298 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  35.98 
 
 
298 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
306 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  33.91 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  31.77 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  37.69 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0047  UbiA prenyltransferase  38.64 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  36.73 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32550  predicted protein  31.14 
 
 
393 aa  93.6  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  29.03 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  31.02 
 
 
306 aa  92.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 
308 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  31.02 
 
 
306 aa  92.4  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  34.74 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  32.19 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  30.11 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001557  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  33.5 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  32.31 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  32.31 
 
 
472 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 
302 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  26.46 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  29.1 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  32.42 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  35.15 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  34.5 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  33.5 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  32.84 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  30.98 
 
 
622 aa  89.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  31.12 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  33.98 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  31.7 
 
 
305 aa  89  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  32.62 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  29.75 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  31.67 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  30.37 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  32.16 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  32.24 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2886  protoheme IX farnesyltransferase  28.63 
 
 
296 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  32.8 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3077  protoheme IX farnesyltransferase  28.63 
 
 
297 aa  85.9  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10772  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  32.1 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  32.16 
 
 
300 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  33.7 
 
 
534 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01722  Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial Precursor (EC 2.5.1.-)(Heme O synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCK8]  33.04 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.69332  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  29.53 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04740  protoheme IX farnesyltransferase, putative  32.99 
 
 
484 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  31.22 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  30.31 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1291  protoheme IX farnesyltransferase  28.57 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000335435  hitchhiker  0.00464829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  33.55 
 
 
535 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  35.63 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  27.08 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3102  protoheme IX farnesyltransferase  28.62 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3064  protoheme IX farnesyltransferase  28.62 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106109  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  33.5 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  29.23 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  28.69 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  33.83 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  33.83 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  29.64 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  28.57 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3245  protoheme IX farnesyltransferase  28.62 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  31.6 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  31.6 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  33.5 
 
 
353 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  32.86 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  30.3 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  32.17 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  29.95 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  29.53 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  26.42 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1039  protoheme IX farnesyltransferase  27.78 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  29.35 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  30.67 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  29.53 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1429  protoheme IX farnesyltransferase  32.02 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0844546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0220  protoheme IX farnesyltransferase  31.31 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3273  protoheme IX farnesyltransferase  27.78 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  29.01 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  29.53 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  32.71 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>