More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2218 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 310 aa  618  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  38.59 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  35.95 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  34.49 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  34.67 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  36.08 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  34.24 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  36.73 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  34.52 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  36.74 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  37.1 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  34.93 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  34 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  36.61 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  36.13 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  36.67 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  33.11 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  37.58 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  36.42 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  36.86 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  34.48 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  36.1 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  38.43 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  36.43 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  36.43 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  36.91 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  37.16 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  37.16 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  37.24 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  34.02 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  37.58 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  33.76 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  40.33 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  36.18 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  39.92 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  37.33 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  36.21 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  33.56 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  34.53 
 
 		 622 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  36.39 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  34.14 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  32.88 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  39.92 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  35.25 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  37 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  35.69 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  36.33 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  36.01 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  33.97 
 
 		 534 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  40.66 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  32.76 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  35.87 
 
 		 341 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  34.67 
 
 		 297 aa  139  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  34.59 
 
 		 535 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  38.4 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  39.39 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  38.8 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  36.67 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  39.76 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  36.99 
 
 		 624 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  36.01 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  33.89 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  34.59 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  32.42 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  32.3 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  33.66 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  36.48 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  32.14 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  34.02 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  34.93 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  33.77 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  33.33 
 
 		 363 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>