More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2204 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  59.21 
 
 		 297 aa  332  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  52.45 
 
 		 292 aa  288  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  44.97 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  41.36 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  40.41 
 
 		 315 aa  205  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  35.95 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  35.12 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  34.39 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  34.39 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  33.9 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  32.31 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 		 317 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  32.62 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  33.67 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  34.58 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  32.53 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  33.57 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  32.76 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  34.17 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  36.16 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  31.8 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  35.42 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  35.06 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  34.26 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  34.26 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  36.97 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  31.31 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  34.62 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  31.42 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  34.96 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  33.69 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  34.24 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  36.82 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  33.79 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  36.82 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  34.62 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  36.82 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  34.32 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  36.19 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  33.94 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  31.74 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  33 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  31.74 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  36.18 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  32.18 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  36.55 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  32.18 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  32.18 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  32.18 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  32.18 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  32.18 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  32.18 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  31.49 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  34.06 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  34.39 
 
 		 534 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03908  protoheme IX farnesyltransferase  31.21 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  36.59 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  36.59 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  32.94 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  36.25 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  35.61 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  35.04 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  35.12 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  35.61 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  36.8 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  36.8 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  36.8 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  33.56 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>