More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01175 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  100 
 
 		 297 aa  596  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  64.56 
 
 		 315 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  41.36 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  43.11 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  36.73 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  34.52 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  35.79 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  33.87 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  34.02 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  34.62 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  32.45 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  32.07 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  30.2 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  30.45 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  39.2 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  34.11 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  32.36 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  29.7 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  33.71 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  34.62 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  33.96 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  33.71 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  33.71 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  35.46 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  34.46 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  33.86 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  30.6 
 
 		 478 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  39.34 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  31.94 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  32.52 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  31.49 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  31.49 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  34.22 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  30.67 
 
 		 534 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  35.8 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  37.07 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  30.9 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  33.95 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  32.88 
 
 		 443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  31 
 
 		 535 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  31.99 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  36.17 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  33.68 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  33.82 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  36.96 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  30.51 
 
 		 317 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  33.68 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  34.21 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  34.21 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  30.42 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  37.99 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  30.07 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  33.58 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  34.19 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  32.71 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4644  protoheme IX farnesyltransferase  32.51 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0297011  normal  0.149911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  33.55 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  36.17 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  31.1 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  33.67 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  30.48 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  31.77 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  31.77 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  31.77 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  31.77 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  34.45 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  31.77 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  31.77 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  30.43 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  30.43 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  31.1 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  30.43 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  31.77 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  29.61 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  30.43 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  31.44 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>