More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32550 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32550  predicted protein  100 
 
 		 393 aa  810    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  43.48 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47531  Heme A farnesyltransferase  34.55 
 
 		 452 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695562  normal  0.861944 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04740  protoheme IX farnesyltransferase, putative  35.6 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35453  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01722  Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial Precursor (EC 2.5.1.-)(Heme O synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCK8]  34.6 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.69332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  31.94 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  31.31 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  36.42 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  34.65 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  35.67 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  30.04 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  31.51 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  30.85 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  31.49 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0253  UbiA prenyltransferase  37.7 
 
 		 271 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  29.8 
 
 		 478 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  30.77 
 
 		 297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  32.86 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  31.88 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  31.14 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  28.67 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  29.54 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  31.3 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1329  protoheme IX farnesyltransferase  29.73 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  32.73 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  31.36 
 
 		 301 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  32.5 
 
 		 300 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4644  protoheme IX farnesyltransferase  30.3 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0297011  normal  0.149911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  30.93 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  30.71 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0895  protoheme IX farnesyltransferase  30.36 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  31.15 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  32.14 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 301 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  29.62 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1145  protoheme IX farnesyltransferase  29.39 
 
 		 295 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  34.4 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  31.62 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  32.26 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  32.14 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  32.26 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  34.84 
 
 		 312 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  30.63 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0223  protoheme IX farnesyl transferase, putative  39.61 
 
 		 270 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  29.11 
 
 		 297 aa  109  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  30.74 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03908  protoheme IX farnesyltransferase  30.6 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  32.01 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  29.1 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0370  protoheme IX farnesyltransferase  32.24 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  29.1 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  29.97 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  29.62 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  28.03 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  29.1 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  29.1 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  32.38 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3077  protoheme IX farnesyltransferase  30.17 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  31.83 
 
 		 292 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  30.68 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4069  protoheme IX farnesyltransferase  31.73 
 
 		 296 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  31.11 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  30.94 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  28.73 
 
 		 295 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.621665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3273  protoheme IX farnesyltransferase  33.91 
 
 		 296 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0220  protoheme IX farnesyltransferase  30.22 
 
 		 303 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1039  protoheme IX farnesyltransferase  33.91 
 
 		 296 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0512  protoheme IX farnesyltransferase  31.22 
 
 		 311 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.207916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  31.94 
 
 		 296 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  28.47 
 
 		 301 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  29.96 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00379  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.013181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3181  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025635  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0468  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.259117 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3205  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0463  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  31.45 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0503  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.153723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47150  protoheme IX farnesyltransferase  31.37 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00383  hypothetical protein  31.43 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0198461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  29.7 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  27.33 
 
 		 622 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  30.43 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  28.31 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  28.31 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  28.31 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>