More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47150  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 296 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4069  protoheme IX farnesyltransferase  99.32 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00379  protoheme IX farnesyltransferase  66.1 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.013181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3181  protoheme IX farnesyltransferase  66.1 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00383  hypothetical protein  66.1 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0198461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0463  protoheme IX farnesyltransferase  66.1 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0503  protoheme IX farnesyltransferase  66.1 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.153723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3205  protoheme IX farnesyltransferase  66.1 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0958  protoheme IX farnesyltransferase  68.47 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110799  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0512  protoheme IX farnesyltransferase  66.1 
 
 		 311 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.207916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0468  protoheme IX farnesyltransferase  66.1 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.259117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1039  protoheme IX farnesyltransferase  67.7 
 
 		 296 aa  387  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3273  protoheme IX farnesyltransferase  67.7 
 
 		 296 aa  387  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0350  protoheme IX farnesyltransferase  66.1 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  65.86 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  65.86 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.621665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2886  protoheme IX farnesyltransferase  68.33 
 
 		 296 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  66.32 
 
 		 296 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  65.86 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  65.86 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  65.86 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0895  protoheme IX farnesyltransferase  65.97 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3077  protoheme IX farnesyltransferase  67.71 
 
 		 297 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1145  protoheme IX farnesyltransferase  64.81 
 
 		 295 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1329  protoheme IX farnesyltransferase  64.56 
 
 		 295 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3245  protoheme IX farnesyltransferase  66.08 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0093  protoheme IX farnesyltransferase  66.2 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1291  protoheme IX farnesyltransferase  65.25 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000335435  hitchhiker  0.00464829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3064  protoheme IX farnesyltransferase  66.08 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3102  protoheme IX farnesyltransferase  66.08 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0816  protoheme IX farnesyltransferase  63.99 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4644  protoheme IX farnesyltransferase  63.51 
 
 		 295 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0297011  normal  0.149911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0853  protoheme IX farnesyltransferase  63.64 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4372  protoheme IX farnesyltransferase  63.99 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0839  protoheme IX farnesyltransferase  63.99 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1294  protoheme IX farnesyltransferase  63.48 
 
 		 296 aa  361  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0220  protoheme IX farnesyltransferase  60.96 
 
 		 303 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4222  protoheme IX farnesyltransferase  61.36 
 
 		 310 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4150  protoheme IX farnesyltransferase  61.36 
 
 		 310 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3827  protoheme IX farnesyltransferase  60.82 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101376 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03908  protoheme IX farnesyltransferase  62.03 
 
 		 298 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4035  protoheme IX farnesyltransferase  60.82 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3918  protoheme IX farnesyltransferase  60.48 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4354  protoheme IX farnesyltransferase  62.24 
 
 		 289 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0370  protoheme IX farnesyltransferase  60.88 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0429  protoheme IX farnesyltransferase  59.93 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3862  protoheme IX farnesyltransferase  60.7 
 
 		 315 aa  339  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367918  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  52.48 
 
 		 288 aa  310  1e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001557  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  47.92 
 
 		 290 aa  269  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  47.52 
 
 		 290 aa  265  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05495  protoheme IX farnesyltransferase  47.42 
 
 		 290 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0982  protoheme IX farnesyltransferase  38.95 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3771  protoheme IX farnesyltransferase  38.03 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.953397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3992  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3857  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00164429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3688  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.583143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3705  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000950979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4063  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4047  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4155  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3960  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1854  protoheme IX farnesyltransferase  39.64 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1192  protoheme IX farnesyltransferase  37.91 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2647  protoheme IX farnesyltransferase  35.19 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  36.47 
 
 		 294 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  38.36 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  36.65 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  37.06 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  34.75 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1429  protoheme IX farnesyltransferase  37.87 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0844546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  34.62 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  34.27 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  33.9 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  39.57 
 
 		 535 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  35.49 
 
 		 324 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  33.92 
 
 		 300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  31.67 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  34.75 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.56 
 
 		 622 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  34.21 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  32.03 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  32.65 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  34.88 
 
 		 534 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>