More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0159 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001557  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  68.42 
 
 		 290 aa  417  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05495  protoheme IX farnesyltransferase  68.42 
 
 		 290 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0512  protoheme IX farnesyltransferase  48.8 
 
 		 311 aa  279  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.207916  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00379  protoheme IX farnesyltransferase  48.97 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.013181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3181  protoheme IX farnesyltransferase  48.97 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0503  protoheme IX farnesyltransferase  48.97 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.153723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0468  protoheme IX farnesyltransferase  48.97 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.259117 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3205  protoheme IX farnesyltransferase  48.97 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0463  protoheme IX farnesyltransferase  48.97 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00383  hypothetical protein  48.97 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0198461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2886  protoheme IX farnesyltransferase  48.77 
 
 		 296 aa  278  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  48.94 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.621665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  48.94 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  48.94 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  48.94 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  48.94 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0816  protoheme IX farnesyltransferase  47.86 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0350  protoheme IX farnesyltransferase  48.62 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0839  protoheme IX farnesyltransferase  47.86 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  49.29 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3077  protoheme IX farnesyltransferase  49.12 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0853  protoheme IX farnesyltransferase  47.14 
 
 		 295 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4372  protoheme IX farnesyltransferase  47.5 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4644  protoheme IX farnesyltransferase  47.14 
 
 		 295 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0297011  normal  0.149911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3273  protoheme IX farnesyltransferase  48.07 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1039  protoheme IX farnesyltransferase  48.07 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0895  protoheme IX farnesyltransferase  48.24 
 
 		 295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0429  protoheme IX farnesyltransferase  48.94 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0220  protoheme IX farnesyltransferase  48.58 
 
 		 303 aa  272  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1294  protoheme IX farnesyltransferase  49.45 
 
 		 296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4069  protoheme IX farnesyltransferase  47.87 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1145  protoheme IX farnesyltransferase  45.71 
 
 		 295 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47150  protoheme IX farnesyltransferase  47.52 
 
 		 296 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4035  protoheme IX farnesyltransferase  46.02 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1329  protoheme IX farnesyltransferase  45.36 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3827  protoheme IX farnesyltransferase  46.02 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3918  protoheme IX farnesyltransferase  46.02 
 
 		 310 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3102  protoheme IX farnesyltransferase  47.87 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3064  protoheme IX farnesyltransferase  47.87 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3245  protoheme IX farnesyltransferase  47.87 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1291  protoheme IX farnesyltransferase  46.79 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000335435  hitchhiker  0.00464829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0370  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4222  protoheme IX farnesyltransferase  45.39 
 
 		 310 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4150  protoheme IX farnesyltransferase  45.39 
 
 		 310 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0093  protoheme IX farnesyltransferase  47 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3862  protoheme IX farnesyltransferase  45.04 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367918  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4354  protoheme IX farnesyltransferase  44.93 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03908  protoheme IX farnesyltransferase  45.04 
 
 		 298 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0958  protoheme IX farnesyltransferase  46.81 
 
 		 296 aa  247  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110799  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  44.72 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  34.39 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  39 
 
 		 622 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0982  protoheme IX farnesyltransferase  35.53 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 317 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  36.46 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1854  protoheme IX farnesyltransferase  36.63 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3771  protoheme IX farnesyltransferase  33.82 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.953397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  37.08 
 
 		 534 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 535 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4047  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3992  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3857  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00164429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3688  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.583143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3705  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000950979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3960  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4155  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1192  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4063  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0706  protoheme IX farnesyltransferase  34.55 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  35.19 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  34.49 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  34.49 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1429  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0844546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  34.76 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  31.93 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  33.46 
 
 		 301 aa  148  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  34.39 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  39.83 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2647  protoheme IX farnesyltransferase  32.72 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  33.48 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  36.61 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  35.97 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  30.88 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1176  protoheme IX farnesyltransferase  36.74 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1198  protoheme IX farnesyltransferase  36.74 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  35.57 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  35.04 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  31.01 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  33.61 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  31.25 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  35.18 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  30.86 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  31.97 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  30.86 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  34.76 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>