More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47531 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_47531  Heme A farnesyltransferase  100 
 
 		 452 aa  931    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695562  normal  0.861944 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01722  Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial Precursor (EC 2.5.1.-)(Heme O synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCK8]  40.78 
 
 		 506 aa  264  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.69332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04740  protoheme IX farnesyltransferase, putative  40.26 
 
 		 484 aa  196  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35453  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  36.82 
 
 		 363 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32550  predicted protein  34.55 
 
 		 393 aa  147  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 		 300 aa  136  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  32.81 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  32.85 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  31.67 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  31.7 
 
 		 301 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  39.78 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  32.61 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  34.95 
 
 		 297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  31.05 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  39.78 
 
 		 294 aa  120  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  30.74 
 
 		 308 aa  120  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  30.77 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  30.56 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  38.24 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  30.51 
 
 		 301 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  30.51 
 
 		 301 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  30.51 
 
 		 301 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  32.34 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  31.37 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  30.11 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  33.61 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  32.17 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  27.3 
 
 		 295 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  28.75 
 
 		 301 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  31.91 
 
 		 298 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  31.31 
 
 		 305 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 		 302 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  30.04 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  30.04 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  29.7 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  29.7 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  33.88 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  30.57 
 
 		 303 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  35.2 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  32.81 
 
 		 305 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  34.59 
 
 		 304 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  33.19 
 
 		 328 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  30.72 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  29.37 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  33.91 
 
 		 300 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  31.78 
 
 		 317 aa  109  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  29.97 
 
 		 304 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  31.68 
 
 		 311 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  30.77 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3771  protoheme IX farnesyltransferase  32.16 
 
 		 307 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.953397  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  28.1 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  28.1 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  29.23 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3992  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3857  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00164429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3688  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.583143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3705  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000950979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4047  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4063  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4155  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3960  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1192  protoheme IX farnesyltransferase  31.28 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  32.29 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  32.29 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  31.6 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  29.43 
 
 		 306 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 		 317 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  29.77 
 
 		 309 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  35.22 
 
 		 301 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  32.97 
 
 		 301 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  28.79 
 
 		 304 aa  103  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  31.7 
 
 		 297 aa  103  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  35.68 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  35.15 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  31.82 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  28.24 
 
 		 312 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  35.15 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  32.11 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  28.68 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  27.53 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  31.22 
 
 		 622 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1429  protoheme IX farnesyltransferase  38.24 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0844546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  32.59 
 
 		 304 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  31.06 
 
 		 300 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  34.2 
 
 		 317 aa  100  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  31.06 
 
 		 300 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  31.06 
 
 		 300 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  31.06 
 
 		 300 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  33.84 
 
 		 295 aa  99.8  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 		 300 aa  99.8  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>