More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0253 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0253  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 271 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0223  protoheme IX farnesyl transferase, putative  61.69 
 
 		 270 aa  291  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0046  UbiA prenyltransferase  49.81 
 
 		 272 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0047  UbiA prenyltransferase  49.03 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1827  protoheme IX farnesyltransferase, putative  42.67 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000128435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0532  UbiA prenyltransferase  39.25 
 
 		 346 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1349  UbiA prenyltransferase  41.67 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  41.36 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  36.32 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  36.08 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  39.36 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  37.44 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  37.44 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32550  predicted protein  37.7 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  37.77 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  37.44 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0220  protoheme IX farnesyltransferase  33.78 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  32.91 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2530  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  38.78 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  31.19 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00379  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.013181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3181  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  35.2 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0468  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.259117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0503  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.153723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0463  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00383  hypothetical protein  30.87 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0198461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3205  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0512  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.207916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3064  protoheme IX farnesyltransferase  29.57 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3102  protoheme IX farnesyltransferase  29.57 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3245  protoheme IX farnesyltransferase  29.57 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  35.45 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0350  protoheme IX farnesyltransferase  30.87 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  33.83 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  30.43 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.621665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  31.7 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  33.51 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  29.52 
 
 		 317 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  32.05 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0895  protoheme IX farnesyltransferase  30 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1039  protoheme IX farnesyltransferase  30.43 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3273  protoheme IX farnesyltransferase  30.43 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  33.17 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  35.22 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  29.44 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  30.73 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  32.59 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3862  protoheme IX farnesyltransferase  32.63 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  36.65 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  31.71 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03908  protoheme IX farnesyltransferase  31.67 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  36.32 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4354  protoheme IX farnesyltransferase  32.34 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4222  protoheme IX farnesyltransferase  32.2 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  34.48 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3918  protoheme IX farnesyltransferase  32.49 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4150  protoheme IX farnesyltransferase  32.2 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  35.23 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0429  protoheme IX farnesyltransferase  31.36 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  32.37 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  31.75 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3827  protoheme IX farnesyltransferase  32.07 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101376 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  34.2 
 
 		 622 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  32.51 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  35.32 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  38.71 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000907307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1854  protoheme IX farnesyltransferase  35.5 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  30.69 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2886  protoheme IX farnesyltransferase  29.57 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1946  protoheme IX farnesyltransferase  36.89 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  32.8 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47150  protoheme IX farnesyltransferase  34.93 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4035  protoheme IX farnesyltransferase  32.07 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  30.73 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  32.31 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3077  protoheme IX farnesyltransferase  30 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4069  protoheme IX farnesyltransferase  34.93 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4644  protoheme IX farnesyltransferase  28.76 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0297011  normal  0.149911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0982  protoheme IX farnesyltransferase  32.34 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001557  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  31.62 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1291  protoheme IX farnesyltransferase  30.94 
 
 		 306 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000335435  hitchhiker  0.00464829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 342 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  32.81 
 
 		 294 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  30.48 
 
 		 323 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  30.48 
 
 		 323 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  34.2 
 
 		 304 aa  99  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1329  protoheme IX farnesyltransferase  30.04 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  28.97 
 
 		 295 aa  98.6  9e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>