More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2530 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2530  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  100 
 
 
276 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1827  protoheme IX farnesyltransferase, putative  37 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000128435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0223  protoheme IX farnesyl transferase, putative  41.21 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0253  UbiA prenyltransferase  38.97 
 
 
271 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0046  UbiA prenyltransferase  38.28 
 
 
272 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129053 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  41.18 
 
 
326 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0532  UbiA prenyltransferase  33.09 
 
 
346 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  40.67 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1537  UbiA prenyltransferase  44.72 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1349  UbiA prenyltransferase  35.78 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  34.68 
 
 
308 aa  95.5  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  32.62 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  33.51 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  39.01 
 
 
296 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  33.66 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  35.52 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  36.22 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  38.22 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0047  UbiA prenyltransferase  39.91 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  32.31 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 
298 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  36.18 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  35.75 
 
 
315 aa  85.9  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  38.15 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  38.15 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00379  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.013181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3181  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025635  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0468  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.259117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  35.47 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  31.98 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  33.18 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0463  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271295  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3205  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  35.91 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00383  hypothetical protein  31.39 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0198461  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0503  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.153723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0512  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.207916  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0350  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  38.92 
 
 
302 aa  82  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  30.94 
 
 
295 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.621665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  30.94 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  35.58 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  30.94 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  30.94 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  30.94 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1329  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1145  protoheme IX farnesyltransferase  34.47 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  33.69 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  33.14 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  41.43 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  31.35 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0958  protoheme IX farnesyltransferase  30.67 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110799  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  35.76 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  35.76 
 
 
333 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  35.76 
 
 
333 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  36.05 
 
 
342 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  36.7 
 
 
345 aa  78.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3102  protoheme IX farnesyltransferase  31.51 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  35.63 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3245  protoheme IX farnesyltransferase  31.51 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  32.4 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3064  protoheme IX farnesyltransferase  31.51 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106109  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  32.8 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  34.76 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  32.28 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0220  protoheme IX farnesyltransferase  30.21 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  28.14 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4644  protoheme IX farnesyltransferase  33.01 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0297011  normal  0.149911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  32.14 
 
 
622 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  35.11 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  31.76 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  38 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  31.69 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1294  protoheme IX farnesyltransferase  29.28 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  36.26 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  36.11 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  32.22 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  36.05 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  36.05 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0895  protoheme IX farnesyltransferase  32.43 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  32.42 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1854  protoheme IX farnesyltransferase  30.48 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  34.09 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  29.25 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  30.65 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  34.55 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05495  protoheme IX farnesyltransferase  31.61 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  34 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  32.62 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  33.87 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>