More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1537 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1537  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
274 aa  528  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1827  protoheme IX farnesyltransferase, putative  40.09 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000128435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0532  UbiA prenyltransferase  35.34 
 
 
346 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  39.39 
 
 
308 aa  99.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0223  protoheme IX farnesyl transferase, putative  35.81 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2530  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  44.94 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0253  UbiA prenyltransferase  35.81 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1349  UbiA prenyltransferase  34.16 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  31.67 
 
 
300 aa  92.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  33.97 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  35.57 
 
 
300 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0046  UbiA prenyltransferase  33.5 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  36.46 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  31.8 
 
 
318 aa  89.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  34.84 
 
 
326 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  31.58 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  35.42 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  32.82 
 
 
294 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  35.08 
 
 
313 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  35.23 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  35.5 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  31.6 
 
 
299 aa  85.9  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  33.65 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  33.65 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  31.65 
 
 
300 aa  85.5  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  36.63 
 
 
300 aa  85.5  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  35.82 
 
 
288 aa  85.5  9e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  33.85 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  34.21 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  30.62 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  34.69 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  30.96 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  32.39 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0047  UbiA prenyltransferase  35.29 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  32.46 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  34.62 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  34.15 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  34 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  32.51 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  31.63 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  32.46 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  32.82 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  32.14 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  33.5 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001557  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  29.08 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  31.17 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  32.06 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  31.53 
 
 
622 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  32.82 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  30.28 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32550  predicted protein  32.42 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3077  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  35.42 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  32 
 
 
341 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  31.79 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1039  protoheme IX farnesyltransferase  33.67 
 
 
296 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3273  protoheme IX farnesyltransferase  33.67 
 
 
296 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  30.95 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  30.95 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  32.31 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  31.6 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  33.03 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  31.4 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  31.31 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  31.4 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  32.47 
 
 
624 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  31.13 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  32.34 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  32.26 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2886  protoheme IX farnesyltransferase  33.17 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  32.16 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  34.83 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  34.83 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  29.57 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  34.83 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  34.83 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  33.85 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  36.17 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  33.5 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.621665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  33 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  31.9 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  31.84 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  31.91 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  31.84 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  33.51 
 
 
483 aa  75.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  31.84 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  40.44 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  30.33 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  31.34 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  33.54 
 
 
472 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  31.34 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  31.84 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4372  protoheme IX farnesyltransferase  32.92 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>