More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1504 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1504  formate dehydrogenase  100 
 
 
180 aa  376  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  99.44 
 
 
934 aa  373  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0805  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  68.6 
 
 
186 aa  256  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2075  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  62.5 
 
 
188 aa  239  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  58.86 
 
 
940 aa  226  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  60.47 
 
 
932 aa  216  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  50.84 
 
 
957 aa  185  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  50.57 
 
 
949 aa  184  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  51.98 
 
 
949 aa  184  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.57 
 
 
949 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  50.57 
 
 
950 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  50 
 
 
950 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  50.57 
 
 
950 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  50 
 
 
950 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  50.57 
 
 
950 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  50.57 
 
 
949 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  51.14 
 
 
949 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  50 
 
 
950 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  50 
 
 
950 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  51.7 
 
 
949 aa  179  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
949 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  50.85 
 
 
951 aa  178  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  52.46 
 
 
964 aa  178  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  50.55 
 
 
951 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  48.6 
 
 
951 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  51.12 
 
 
951 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  51.12 
 
 
951 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  48.04 
 
 
951 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.02 
 
 
950 aa  175  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.02 
 
 
949 aa  175  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  47.19 
 
 
951 aa  174  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  47.75 
 
 
951 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.46 
 
 
950 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  47.46 
 
 
950 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  47.46 
 
 
950 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  48.66 
 
 
986 aa  171  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  47.46 
 
 
950 aa  171  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  47.46 
 
 
950 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  47.46 
 
 
950 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  47.46 
 
 
950 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  46.89 
 
 
950 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  47.46 
 
 
950 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  46.63 
 
 
953 aa  168  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  51.72 
 
 
979 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  49.72 
 
 
962 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  50.57 
 
 
987 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  59.38 
 
 
980 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  46.89 
 
 
1012 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  43.43 
 
 
992 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  44.83 
 
 
973 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  50.29 
 
 
991 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  57.81 
 
 
980 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  49.32 
 
 
983 aa  157  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  57.81 
 
 
980 aa  157  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  47.46 
 
 
970 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  57.81 
 
 
980 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  45.71 
 
 
988 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  48 
 
 
986 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  46.29 
 
 
991 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  48 
 
 
1025 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  44.57 
 
 
989 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  44.83 
 
 
973 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  45.14 
 
 
999 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  45.71 
 
 
1001 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  44 
 
 
989 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  45.71 
 
 
1001 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  47.46 
 
 
994 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  45.2 
 
 
996 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  41.4 
 
 
1111 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.36 
 
 
685 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.69 
 
 
662 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2590  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.98 
 
 
196 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.98 
 
 
1010 aa  98.2  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.22 
 
 
676 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2268  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  32.64 
 
 
190 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.22 
 
 
676 aa  96.3  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2089  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.41 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.578931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.05 
 
 
1016 aa  95.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.94 
 
 
1020 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.46 
 
 
676 aa  94.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.38 
 
 
1012 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1576  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.03 
 
 
200 aa  94.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.94 
 
 
1020 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.64 
 
 
1009 aa  94.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.77 
 
 
657 aa  94.4  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3512  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.97 
 
 
188 aa  94  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.54 
 
 
1059 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.85 
 
 
1061 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.53 
 
 
674 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.53 
 
 
674 aa  92.8  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.85 
 
 
355 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.46 
 
 
677 aa  92  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1796  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.39 
 
 
135 aa  91.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.53 
 
 
674 aa  91.7  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.76 
 
 
674 aa  90.9  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.79 
 
 
1066 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.85 
 
 
1013 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.78 
 
 
721 aa  89.4  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2946  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.36 
 
 
135 aa  88.2  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.750797  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5532  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  32.49 
 
 
196 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>