243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0870 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0870  a-glycosyltransferase  100 
 
 
361 aa  743    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.179475  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02940  polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.86 
 
 
364 aa  172  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
400 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0790  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.61 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  25.76 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25.46 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.18 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
768 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
395 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  29.35 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0287  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
412 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 
401 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  23.21 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  26.85 
 
 
357 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.62 
 
 
378 aa  59.3  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
426 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
396 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
410 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
394 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  26.79 
 
 
598 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  26.88 
 
 
398 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
412 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  25 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 
365 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
410 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
1080 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
412 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
412 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
394 aa  53.1  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  21.35 
 
 
371 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  21.54 
 
 
426 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  21.32 
 
 
373 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
388 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  26.47 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
1079 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.59 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  32.86 
 
 
376 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
355 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.43 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  31.67 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.21 
 
 
390 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  23.03 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.21 
 
 
372 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  21.26 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  34.29 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
394 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
356 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
398 aa  50.4  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
419 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
371 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  20.98 
 
 
385 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  33.57 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  21.54 
 
 
396 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  24.04 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>