136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0973 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0973  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0109985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  34.75 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.12 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  30.08 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.31 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  29.53 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  33.83 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  34.75 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  35.82 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  26.81 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  33.58 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  30.07 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  35.11 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  29.23 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  28.15 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  32.79 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  30.3 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  32.21 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  32.33 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  32.2 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  35.96 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  30.3 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  33.03 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  30.3 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  32.2 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  30.71 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  30.99 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  31.93 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  30.3 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  34.75 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  33.05 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  33.05 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  30.5 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  32.48 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  32.76 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  35.59 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  30.08 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  32.77 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  42.25 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  32.77 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  31.39 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  35.16 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  28.19 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  34.86 
 
 		 114 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  34.23 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  30.61 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  33.03 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  29.92 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  38.03 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  32.09 
 
 		 133 aa  47.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  32.79 
 
 		 143 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  43.66 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  30.7 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  30.6 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  28.06 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  31.36 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  30.66 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  32.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  32.76 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  27.78 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  31.62 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  31.36 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  26.72 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  31.36 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  27.87 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  28.81 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  29.77 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  29.77 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.1 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  29.25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  29.25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  31.01 
 
 		 138 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  30.23 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  28.83 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  33.59 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  32.99 
 
 		 130 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  30.88 
 
 		 141 aa  44.7  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  26.53 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  28.79 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  33.91 
 
 		 147 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  31.82 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  28.15 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  28.15 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  28.44 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  30.83 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  28.21 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  28.37 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  30.53 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  33.64 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>