More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3750 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
339 aa  701    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  97.94 
 
 
339 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  87.68 
 
 
345 aa  617  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  85.25 
 
 
338 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  85.25 
 
 
338 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  85.25 
 
 
338 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  84.96 
 
 
338 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  84.96 
 
 
338 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  84.96 
 
 
338 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  84.96 
 
 
338 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  84.07 
 
 
338 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  82.3 
 
 
338 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  81.12 
 
 
338 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  81.71 
 
 
338 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  80.83 
 
 
338 aa  577  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  81.71 
 
 
338 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  81.12 
 
 
338 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  81.71 
 
 
338 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  66.25 
 
 
324 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  65.3 
 
 
323 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  65.3 
 
 
323 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.69 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.72 
 
 
322 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.15 
 
 
343 aa  428  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.41 
 
 
322 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.41 
 
 
322 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.41 
 
 
322 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  65.31 
 
 
326 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.75 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0755  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.01 
 
 
323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0800401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  62.34 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.26 
 
 
339 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
334 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.99 
 
 
337 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  59.62 
 
 
334 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.62 
 
 
334 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.43 
 
 
336 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
334 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
334 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.18 
 
 
329 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.75 
 
 
336 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
334 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.68 
 
 
358 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.62 
 
 
358 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.68 
 
 
358 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.31 
 
 
334 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  59.62 
 
 
334 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.25 
 
 
344 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.7 
 
 
317 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1950  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.12 
 
 
334 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.189819  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.01 
 
 
339 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0398  dipeptide transporter ATP-binding subunit  56.44 
 
 
348 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.73 
 
 
329 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2051  dipeptide transporter ATP-binding subunit  56.88 
 
 
325 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.13 
 
 
317 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1694  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.32 
 
 
334 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.43 
 
 
335 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2262  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.74 
 
 
322 aa  348  9e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0262403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.54 
 
 
336 aa  335  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.918096  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.04 
 
 
344 aa  334  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1914  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.36 
 
 
321 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.04 
 
 
344 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2812  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.04 
 
 
368 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4489  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.4 
 
 
349 aa  332  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2551  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.69 
 
 
322 aa  332  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2420  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.86 
 
 
369 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2254  oligopeptide ABC transporter, ATPase component  49.69 
 
 
322 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.46 
 
 
332 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.85 
 
 
339 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1181  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  51.47 
 
 
335 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0737036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0417  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 
327 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777417  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.11 
 
 
338 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0992  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.71 
 
 
326 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.663294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1011  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.71 
 
 
326 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.289236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.65 
 
 
329 aa  329  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0453  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.72 
 
 
336 aa  329  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.219882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  51.69 
 
 
333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.94 
 
 
321 aa  328  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  49.69 
 
 
325 aa  328  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19042  hitchhiker  0.00501998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.35 
 
 
355 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0867  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.32 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0889  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.01 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5354  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  52.6 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  49.22 
 
 
352 aa  325  7e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.788659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1796  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.36 
 
 
338 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.749198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  49.08 
 
 
368 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3497  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
329 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 
326 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1062  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 
336 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  53.04 
 
 
337 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1064  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.94 
 
 
343 aa  322  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 
355 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0537  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.48 
 
 
444 aa  322  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128807  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0481  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.98 
 
 
333 aa  322  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000513097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>