More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3903 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
339 aa  703    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  92.79 
 
 
335 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  87.69 
 
 
336 aa  609  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  87.69 
 
 
336 aa  608  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  88.41 
 
 
334 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  88.72 
 
 
334 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  86.45 
 
 
358 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  86.75 
 
 
358 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  86.45 
 
 
358 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  89.44 
 
 
334 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  89.44 
 
 
334 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  89.44 
 
 
334 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.75 
 
 
334 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  88.41 
 
 
334 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.44 
 
 
334 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  88.11 
 
 
337 aa  596  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.44 
 
 
334 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.44 
 
 
337 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.44 
 
 
337 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.44 
 
 
337 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.44 
 
 
337 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.44 
 
 
337 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  88.75 
 
 
329 aa  587  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  70.18 
 
 
342 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.46 
 
 
317 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.5 
 
 
317 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.2 
 
 
324 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.25 
 
 
323 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.26 
 
 
339 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2051  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.31 
 
 
325 aa  384  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.57 
 
 
339 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.95 
 
 
339 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0398  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.02 
 
 
348 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.36 
 
 
322 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.36 
 
 
322 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.88 
 
 
329 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.36 
 
 
322 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.82 
 
 
338 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.82 
 
 
338 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.36 
 
 
322 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.82 
 
 
338 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.82 
 
 
338 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.2 
 
 
338 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.51 
 
 
338 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.88 
 
 
326 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.51 
 
 
338 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.04 
 
 
323 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.82 
 
 
338 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.82 
 
 
338 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.04 
 
 
323 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.82 
 
 
338 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.7 
 
 
345 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.2 
 
 
338 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.2 
 
 
338 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.51 
 
 
338 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.51 
 
 
338 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.2 
 
 
338 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.04 
 
 
343 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1694  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.18 
 
 
334 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1950  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.49 
 
 
334 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.189819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  57.41 
 
 
319 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0755  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.1 
 
 
323 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0800401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.39 
 
 
344 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.95 
 
 
423 aa  340  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  61.69 
 
 
282 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.11 
 
 
282 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.1 
 
 
326 aa  335  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2262  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.43 
 
 
322 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0262403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.84 
 
 
338 aa  333  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2551  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 
322 aa  330  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0417  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.1 
 
 
327 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777417  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2254  oligopeptide ABC transporter, ATPase component  50.47 
 
 
322 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.59 
 
 
321 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5508  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.98 
 
 
355 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.444532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.44 
 
 
336 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2450  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.16 
 
 
325 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2366  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.15 
 
 
332 aa  328  9e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.343189  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.12 
 
 
336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1711  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.5 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0333  ABC transporter related  58.65 
 
 
275 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  58.3 
 
 
282 aa  325  8.000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1914  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 
321 aa  325  9e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  52.53 
 
 
349 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1064  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.41 
 
 
343 aa  324  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0481  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.23 
 
 
333 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000513097  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.85 
 
 
355 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.95 
 
 
388 aa  323  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3497  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.97 
 
 
329 aa  323  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0816  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 
339 aa  322  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1011  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.08 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.289236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0992  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.08 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.663294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50.95 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0826  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.99 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6951  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  49.52 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1764  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.42 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.897855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0270  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0807  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 
323 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0245  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1000  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.90335e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>