More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2360 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
344 aa  699    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.04 
 
 
324 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.07 
 
 
322 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.46 
 
 
338 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.07 
 
 
322 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.07 
 
 
322 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.07 
 
 
322 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.46 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.5 
 
 
323 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.46 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.46 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.44 
 
 
326 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.46 
 
 
338 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.99 
 
 
358 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.99 
 
 
358 aa  401  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.25 
 
 
339 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.25 
 
 
339 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.83 
 
 
338 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.99 
 
 
358 aa  401  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.83 
 
 
338 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.75 
 
 
345 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.25 
 
 
323 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.44 
 
 
329 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.83 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.15 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.83 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.19 
 
 
323 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.83 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.15 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.13 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.83 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.15 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.14 
 
 
336 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.22 
 
 
317 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.57 
 
 
343 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.62 
 
 
329 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.57 
 
 
338 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0398  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.19 
 
 
348 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  61.83 
 
 
319 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.5 
 
 
336 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2051  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.37 
 
 
325 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1694  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.42 
 
 
334 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  60.19 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  60.19 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.19 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.19 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.8 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.19 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.8 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  60.19 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.19 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.26 
 
 
317 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.88 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.19 
 
 
334 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.8 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.8 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  60.8 
 
 
337 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.39 
 
 
339 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.44 
 
 
339 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.54 
 
 
337 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0755  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.68 
 
 
323 aa  381  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0800401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1950  dipeptide transporter ATP-binding subunit  61.13 
 
 
334 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.189819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  62.97 
 
 
335 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.15 
 
 
339 aa  342  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  54.71 
 
 
328 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0889  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.46 
 
 
338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.63 
 
 
321 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0867  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.46 
 
 
338 aa  338  7e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.48 
 
 
326 aa  335  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.78 
 
 
326 aa  333  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.7 
 
 
336 aa  333  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756005  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.46 
 
 
336 aa  332  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.918096  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6652  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.15 
 
 
355 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  49.7 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111978  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2262  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.79 
 
 
322 aa  325  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0262403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6951  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
332 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1552  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.22 
 
 
332 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.24 
 
 
370 aa  323  2e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0709031  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0807  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.15 
 
 
323 aa  322  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  51.23 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0906  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  50.48 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0105903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2174  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  52.02 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.837034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50.15 
 
 
337 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0949  oligopeptide transport ATP-binding protein AppF  46.52 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6444  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.98 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.247483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0912  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.52 
 
 
323 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0863  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.52 
 
 
326 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1000  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
323 aa  318  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.90335e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4382  oligopeptide transport ATP-binding protein AppF  46.52 
 
 
323 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1004  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
323 aa  318  9e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0811  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
326 aa  318  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2551  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 
322 aa  318  9e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1078  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
334 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0826  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
326 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0235  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.94 
 
 
337 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0987  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.94 
 
 
318 aa  317  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000207029  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.14 
 
 
282 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2254  oligopeptide ABC transporter, ATPase component  48.89 
 
 
322 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 
316 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4158  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.22 
 
 
342 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>