More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1530 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
343 aa  713    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0755  dipeptide transporter ATP-binding subunit  85.31 
 
 
323 aa  578  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0800401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  66.77 
 
 
345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.41 
 
 
338 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  68.37 
 
 
324 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.4 
 
 
338 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.69 
 
 
338 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.4 
 
 
338 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.69 
 
 
338 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.69 
 
 
338 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.4 
 
 
338 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.4 
 
 
338 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.09 
 
 
338 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  65.22 
 
 
323 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.78 
 
 
338 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.09 
 
 
338 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.09 
 
 
338 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.09 
 
 
338 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.15 
 
 
339 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  64.47 
 
 
339 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.75 
 
 
338 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  65.22 
 
 
323 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  63.75 
 
 
338 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  66.77 
 
 
322 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  66.67 
 
 
323 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  66.45 
 
 
322 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  66.45 
 
 
322 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  66.45 
 
 
322 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  66.46 
 
 
326 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.38 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  56.14 
 
 
358 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  56.14 
 
 
358 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  56.14 
 
 
358 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.68 
 
 
337 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  58.04 
 
 
334 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.04 
 
 
334 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.04 
 
 
334 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.04 
 
 
334 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.04 
 
 
334 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  62.18 
 
 
319 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.68 
 
 
337 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.04 
 
 
334 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.68 
 
 
337 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.36 
 
 
334 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.68 
 
 
337 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.68 
 
 
337 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.04 
 
 
334 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.45 
 
 
337 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  58.04 
 
 
334 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.14 
 
 
329 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  56.57 
 
 
336 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  56.88 
 
 
336 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.75 
 
 
344 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  58.04 
 
 
339 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.42 
 
 
317 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  59.6 
 
 
317 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1950  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.99 
 
 
334 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.189819  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  55.49 
 
 
339 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.88 
 
 
329 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2051  dipeptide transporter ATP-binding subunit  56.13 
 
 
325 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  56.71 
 
 
335 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0398  dipeptide transporter ATP-binding subunit  55.03 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1694  dipeptide transporter ATP-binding subunit  57.1 
 
 
334 aa  348  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.38 
 
 
329 aa  344  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.95 
 
 
326 aa  339  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.48 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 
321 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 
423 aa  334  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  51.27 
 
 
349 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2403  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.92 
 
 
425 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.16 
 
 
328 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84761  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.94 
 
 
336 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2262  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.15 
 
 
322 aa  329  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0262403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.76 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.85 
 
 
362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0537  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
444 aa  325  8.000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128807  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1181  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.4 
 
 
335 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0737036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  51.11 
 
 
337 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2128  ATP-binding protein of oligopeptide ABC transporter  51.43 
 
 
345 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.24 
 
 
332 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 
355 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1914  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 
321 aa  322  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 
352 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00715286  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5508  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.06 
 
 
355 aa  322  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.444532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1385  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.68 
 
 
335 aa  322  8e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.14 
 
 
364 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  53.92 
 
 
370 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3024  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  49.53 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0235  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.64 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  49.53 
 
 
368 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3421  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 
369 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5910  peptide ABC transporter ATP-binding protein  50.32 
 
 
339 aa  318  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0678087  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1340  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  46.29 
 
 
342 aa  318  6e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.801873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.75 
 
 
326 aa  318  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1950  oligopeptide transport ATP-binding protein F  49.08 
 
 
330 aa  318  7.999999999999999e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1064  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.99 
 
 
343 aa  317  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.47 
 
 
338 aa  317  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2254  oligopeptide ABC transporter, ATPase component  48.73 
 
 
322 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2299  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.05 
 
 
391 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000220082  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0559  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
340 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.98385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>