More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1119 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  100 
 
 		 383 aa  768    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  93.99 
 
 		 383 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  78.59 
 
 		 383 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  79.63 
 
 		 369 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  70.5 
 
 		 363 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  71.02 
 
 		 362 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  70.5 
 
 		 362 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  70.5 
 
 		 362 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  70.5 
 
 		 362 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  70.5 
 
 		 362 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  70.5 
 
 		 362 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  70.5 
 
 		 362 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  66.33 
 
 		 375 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  65.14 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  65.68 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  66.12 
 
 		 359 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  65.41 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  64.77 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  64.77 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  64.77 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  44.99 
 
 		 370 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  43.11 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  43.59 
 
 		 371 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  43.59 
 
 		 371 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  43.59 
 
 		 371 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  43.33 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  43.33 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  43.33 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  43.33 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  44.12 
 
 		 367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  43.85 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  43.85 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  43.32 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  43.52 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  43.32 
 
 		 368 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  43.32 
 
 		 368 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  42.4 
 
 		 369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  40.36 
 
 		 354 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  40.6 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  39.05 
 
 		 399 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  39.34 
 
 		 353 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  39.4 
 
 		 355 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  38.9 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  37.53 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  35.84 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  38.27 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  34.29 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  35.96 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  34.15 
 
 		 365 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  30.93 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.79 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.79 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  31.35 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.07 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  31.39 
 
 		 352 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.23 
 
 		 358 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.35 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  29.77 
 
 		 352 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  29.61 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.24 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  30.71 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.06 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  31.16 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  32.61 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  32.11 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.33 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  32.01 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  32.01 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.68 
 
 		 392 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  30.63 
 
 		 362 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  31.75 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.75 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  38.2 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  32.02 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  29.76 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  36.67 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  31.33 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  31.88 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  31.41 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  38.03 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  37.68 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.57 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  31.38 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  31.22 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.05 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  31.28 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  31.63 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  35 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.25 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  31.47 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.77 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  31.56 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  31.31 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  31.59 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  35.27 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  32.76 
 
 		 373 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>