More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4097 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  85.28 
 
 
371 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  85.28 
 
 
371 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  85.28 
 
 
371 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  93.73 
 
 
369 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  93.75 
 
 
368 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  85.28 
 
 
371 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  85.28 
 
 
371 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  94.55 
 
 
369 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  100 
 
 
367 aa  751    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  92.93 
 
 
368 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  85.28 
 
 
371 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  85.28 
 
 
371 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  93.5 
 
 
369 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  93.75 
 
 
368 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  85.28 
 
 
371 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  78.27 
 
 
361 aa  584  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  74.11 
 
 
370 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  47.68 
 
 
375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  46.01 
 
 
354 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  46.07 
 
 
358 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  47.33 
 
 
362 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  46.52 
 
 
362 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  46.52 
 
 
362 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  46.52 
 
 
362 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  46.52 
 
 
362 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  46.52 
 
 
362 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  46.52 
 
 
362 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  46.52 
 
 
363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  44 
 
 
350 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  46.65 
 
 
360 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  46.52 
 
 
359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  46.65 
 
 
361 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  45.81 
 
 
360 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  46.24 
 
 
358 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  45.96 
 
 
359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  45.96 
 
 
359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  42.86 
 
 
353 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  45.33 
 
 
369 aa  262  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  43.33 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  44.09 
 
 
383 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  43.57 
 
 
383 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  40.22 
 
 
373 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  40.85 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  39.02 
 
 
372 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  40 
 
 
352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  38.44 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  36.62 
 
 
399 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  37.01 
 
 
365 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  37.6 
 
 
369 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  32.43 
 
 
376 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  34.07 
 
 
386 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  34.07 
 
 
386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  34.56 
 
 
449 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.23 
 
 
355 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.3 
 
 
363 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.3 
 
 
363 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  32.03 
 
 
365 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.69 
 
 
363 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.69 
 
 
363 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.69 
 
 
363 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  31.58 
 
 
374 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.89 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  33.52 
 
 
352 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  32.22 
 
 
363 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  31.68 
 
 
368 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.5 
 
 
355 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.5 
 
 
355 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  31.51 
 
 
364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  31.38 
 
 
379 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  31.35 
 
 
377 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.05 
 
 
358 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.32 
 
 
367 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  31.03 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.79 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  30.95 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  31.16 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.62 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  30.42 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  31.58 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  33.44 
 
 
392 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  30.48 
 
 
379 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  31.48 
 
 
372 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  30.48 
 
 
379 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  29.63 
 
 
373 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.21 
 
 
392 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.23 
 
 
383 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.21 
 
 
392 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  31.66 
 
 
363 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  27.68 
 
 
389 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  31.83 
 
 
357 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.4 
 
 
361 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  29.7 
 
 
371 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.56 
 
 
363 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  30.51 
 
 
352 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.35 
 
 
363 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  31.35 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  31.35 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  32.07 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.73 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  30.11 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>