More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6217 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6217  type II secretion system protein E  100 
 
 
500 aa  1021    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0378  pili biogenesis ATPase  39.58 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  41.35 
 
 
586 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  50 
 
 
520 aa  170  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  50.52 
 
 
520 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  41.16 
 
 
505 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.22 
 
 
570 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  39.69 
 
 
693 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  39.69 
 
 
693 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.22 
 
 
570 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0626  hypothetical protein  42.26 
 
 
473 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.93 
 
 
570 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.22 
 
 
570 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  46.77 
 
 
507 aa  166  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  49.48 
 
 
520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.61 
 
 
577 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  53.22 
 
 
577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  35.5 
 
 
568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  39.85 
 
 
573 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  40 
 
 
517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  39.92 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  48.47 
 
 
514 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  34.22 
 
 
606 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.86 
 
 
569 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.22 
 
 
577 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  38.8 
 
 
493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  38.8 
 
 
493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  34.63 
 
 
569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  40.46 
 
 
514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.17 
 
 
568 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  38.8 
 
 
493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  38.8 
 
 
493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.11 
 
 
569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  38.8 
 
 
493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.46 
 
 
577 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  35.38 
 
 
569 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  48.21 
 
 
518 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.63 
 
 
569 aa  163  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.4 
 
 
569 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
483 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  30.79 
 
 
566 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  52.94 
 
 
502 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.94 
 
 
521 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.52 
 
 
569 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  52.94 
 
 
502 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.77 
 
 
562 aa  161  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
482 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.51 
 
 
569 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.91 
 
 
520 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  49.74 
 
 
497 aa  160  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.96 
 
 
569 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  49.75 
 
 
515 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  40.89 
 
 
482 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  36.94 
 
 
563 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3499  hypothetical protein  45.59 
 
 
512 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1042  hypothetical protein  45.59 
 
 
518 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0653884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3371  hypothetical protein  45.59 
 
 
512 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.25 
 
 
568 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  31.46 
 
 
553 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  41.94 
 
 
642 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  44.6 
 
 
841 aa  159  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1311  type II/IV secretion system protein  44.84 
 
 
407 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  37.33 
 
 
559 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2531  type II/IV secretion system protein  44.84 
 
 
419 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  46.43 
 
 
494 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3527  type IV fimbrial biogenesis protein,PilB  44.84 
 
 
419 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  34.54 
 
 
553 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.85 
 
 
571 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
561 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3506  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.84 
 
 
407 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3251  type II/IV secretion system protein  44.84 
 
 
407 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  48.45 
 
 
522 aa  158  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0453  type II/IV secretion system protein  44.84 
 
 
407 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  35.48 
 
 
538 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  34.28 
 
 
577 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  46.43 
 
 
494 aa  158  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3531  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.84 
 
 
407 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  52.35 
 
 
495 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  35.41 
 
 
578 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  33.64 
 
 
587 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  46.15 
 
 
491 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  47.42 
 
 
489 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  38.11 
 
 
554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  40.49 
 
 
482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  33.81 
 
 
569 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  32.16 
 
 
574 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.81 
 
 
569 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  36.7 
 
 
503 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  37.91 
 
 
486 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  34.16 
 
 
586 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.35 
 
 
555 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  38.44 
 
 
577 aa  156  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  50.26 
 
 
498 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  34.37 
 
 
586 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0872  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway PilB-like  45 
 
 
548 aa  156  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  34.37 
 
 
586 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  48.19 
 
 
561 aa  156  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  49.74 
 
 
497 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  34.37 
 
 
586 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  49.74 
 
 
497 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>