More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6970 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  880    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  71.29 
 
 
437 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  99.53 
 
 
428 aa  876    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  99.53 
 
 
428 aa  876    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  70.42 
 
 
436 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  67.06 
 
 
443 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  70.16 
 
 
430 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  65.8 
 
 
441 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  67.61 
 
 
435 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  65.25 
 
 
436 aa  591  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  64.71 
 
 
435 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  65.57 
 
 
441 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  63.92 
 
 
441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  65.48 
 
 
443 aa  567  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  63.53 
 
 
429 aa  548  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  60.75 
 
 
444 aa  491  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  54.61 
 
 
439 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  52.86 
 
 
438 aa  462  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 
432 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  47.54 
 
 
436 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  45.99 
 
 
435 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  45.27 
 
 
428 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  46.95 
 
 
437 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  44.99 
 
 
435 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  43.93 
 
 
431 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  41.4 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  41.75 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  40.53 
 
 
430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  42.28 
 
 
445 aa  302  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  41.53 
 
 
430 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  41.83 
 
 
431 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  40.74 
 
 
436 aa  300  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  42.54 
 
 
431 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 
444 aa  293  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  40.53 
 
 
432 aa  292  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  42.47 
 
 
424 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  41.02 
 
 
438 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  39.51 
 
 
431 aa  289  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  40.72 
 
 
432 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  41.32 
 
 
447 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  39.36 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  41.01 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  40.34 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  38.34 
 
 
430 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  38.77 
 
 
424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  41.61 
 
 
431 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  39.52 
 
 
432 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  38.92 
 
 
422 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  41.12 
 
 
431 aa  279  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  37.18 
 
 
430 aa  279  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  37.18 
 
 
430 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  39.38 
 
 
427 aa  278  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 
433 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  42.54 
 
 
429 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  39.09 
 
 
439 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  41.73 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 
429 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  38.07 
 
 
434 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  38.07 
 
 
434 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  37.61 
 
 
434 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  38.26 
 
 
436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  38.05 
 
 
430 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  39 
 
 
437 aa  272  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  37.59 
 
 
428 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 
437 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  39.16 
 
 
426 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  39.07 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  37.83 
 
 
428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  39.51 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  41.12 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  40.35 
 
 
431 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 
429 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  37.79 
 
 
437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  36.95 
 
 
429 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 
434 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  38.13 
 
 
425 aa  266  5e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  36.88 
 
 
429 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  36.39 
 
 
429 aa  266  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  37.9 
 
 
429 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  36.83 
 
 
433 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 
429 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  37.11 
 
 
430 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  36.39 
 
 
429 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  37.66 
 
 
426 aa  264  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  37.99 
 
 
432 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  37.72 
 
 
440 aa  263  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  36.34 
 
 
429 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  36.34 
 
 
429 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  36.34 
 
 
429 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  36.08 
 
 
430 aa  261  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  40.44 
 
 
435 aa  259  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  35.64 
 
 
429 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  36.89 
 
 
434 aa  259  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  36.1 
 
 
429 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 
440 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  37.8 
 
 
439 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  36.1 
 
 
429 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  37.8 
 
 
439 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  39.42 
 
 
431 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  38.33 
 
 
434 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>