More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0309 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 443 aa  921    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  69.34 
 
 		 436 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  70.05 
 
 		 441 aa  626  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  70.6 
 
 		 443 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  69.41 
 
 		 435 aa  621  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  67.06 
 
 		 428 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  70.96 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  65.6 
 
 		 437 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  67.06 
 
 		 428 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  67.06 
 
 		 428 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  67.69 
 
 		 441 aa  613  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  67.21 
 
 		 436 aa  612  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  65.49 
 
 		 435 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  65.26 
 
 		 441 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  60.94 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  56.97 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  54.03 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  52.38 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  45.33 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  45.2 
 
 		 435 aa  362  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  44.24 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  45.54 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  44.1 
 
 		 435 aa  355  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  41.15 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  41.61 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  40.83 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  40.39 
 
 		 431 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  40.73 
 
 		 436 aa  289  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  38.93 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  39.71 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  38.63 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  40.15 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  39.55 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  39.23 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  38.63 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  38.9 
 
 		 426 aa  276  4e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  37.22 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  38.98 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  36.75 
 
 		 429 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  38.83 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  38.93 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  38.83 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  38.2 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  37.9 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  37.01 
 
 		 427 aa  266  5e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  39.94 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 		 429 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  37.37 
 
 		 429 aa  266  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  38.61 
 
 		 437 aa  265  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  37 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  37 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  36.87 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 		 433 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  39.15 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  36 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  38.5 
 
 		 447 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  36.56 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  36.56 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  38.07 
 
 		 438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  36.67 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  36.97 
 
 		 436 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  36.59 
 
 		 430 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  36.92 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  37.96 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  37.96 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  36.67 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  37.77 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  36.25 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  36.88 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  36.79 
 
 		 434 aa  256  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  35.94 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  36.36 
 
 		 427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  34.79 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  37.05 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  34.77 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  37.23 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  36.57 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  34.77 
 
 		 449 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  35.77 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  35.77 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  36.12 
 
 		 440 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  37.11 
 
 		 430 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  36.86 
 
 		 429 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  35.56 
 
 		 434 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  40.95 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  33.9 
 
 		 424 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  37.22 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  32.62 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  35.05 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  36.43 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  36.04 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>