More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0497 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
430 aa  884    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  68.84 
 
 
430 aa  614  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  63.93 
 
 
428 aa  555  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  60.28 
 
 
430 aa  544  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  60.23 
 
 
428 aa  535  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  59.58 
 
 
430 aa  534  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 
429 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
429 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  50.47 
 
 
431 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
436 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
429 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  52.29 
 
 
437 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
430 aa  438  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  53.77 
 
 
424 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  50.74 
 
 
430 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  48.94 
 
 
436 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  51.09 
 
 
426 aa  420  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  48.45 
 
 
454 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 
436 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  47.46 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  49.06 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  47.89 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  47.64 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  47.04 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  53.15 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 
426 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  47.89 
 
 
436 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  48.69 
 
 
441 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  48.45 
 
 
441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  48.01 
 
 
439 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  47.64 
 
 
441 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  47.98 
 
 
448 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  47.32 
 
 
440 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  48.21 
 
 
440 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  47.41 
 
 
438 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  47.64 
 
 
440 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  48.46 
 
 
447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  47.74 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  47.27 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  48.56 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  47.75 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  46.71 
 
 
432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  47.64 
 
 
441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  46.6 
 
 
439 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  46.37 
 
 
439 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  49 
 
 
429 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  45.22 
 
 
434 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  44.75 
 
 
441 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  48.66 
 
 
428 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  47.84 
 
 
432 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  47.97 
 
 
427 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  49.25 
 
 
429 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  49.25 
 
 
436 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  45.86 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  49.25 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  49.76 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  46.25 
 
 
424 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  45.67 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  48.19 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  48.5 
 
 
429 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  47.78 
 
 
438 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  47.31 
 
 
445 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  46.38 
 
 
427 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  48.68 
 
 
428 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  48.5 
 
 
429 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  45.69 
 
 
430 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  47.17 
 
 
447 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 
429 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 
429 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
445 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 
434 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  45.81 
 
 
433 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
445 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 
429 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  47.78 
 
 
438 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0753  histidinol dehydrogenase  44.93 
 
 
473 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
445 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 
429 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  47.66 
 
 
439 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  47.54 
 
 
447 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  47.78 
 
 
440 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  46.84 
 
 
438 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  48.23 
 
 
440 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  46.12 
 
 
432 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
445 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  47.78 
 
 
438 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  47.78 
 
 
438 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
445 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
445 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
445 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
438 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  46.75 
 
 
433 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  47.31 
 
 
438 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  47.99 
 
 
440 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
438 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>