More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3100 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 429 aa  859    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  93.71 
 
 		 436 aa  816    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  79.02 
 
 		 432 aa  669    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  79.25 
 
 		 429 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  86.25 
 
 		 429 aa  752    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  80.19 
 
 		 429 aa  715    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  80.84 
 
 		 430 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  70.86 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  53.61 
 
 		 430 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  56.64 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  57.48 
 
 		 440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  57.21 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  57.24 
 
 		 440 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  54.55 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  54.27 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  53.92 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  55.94 
 
 		 436 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  51.21 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  55.69 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  55.37 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  55.37 
 
 		 448 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  55.94 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  56.02 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  56.18 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  54.31 
 
 		 433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  55.87 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  52.69 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  51.42 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  54.91 
 
 		 440 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  53.52 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  54.35 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  55.5 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  54.19 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  55.01 
 
 		 439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  54.78 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  52.76 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  53.88 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  53.88 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  53.26 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  56.44 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  54.65 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  53.88 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  56.44 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  55.61 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  54.67 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  54.67 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  55.2 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  55.84 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  55.2 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  55.2 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  54.19 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  55.4 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  54.19 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  53.94 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  54.43 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  53.81 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  53.81 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  53.72 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  54.73 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  54.19 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  53.35 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  54.73 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  51.52 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  55.97 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  54.73 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  54.73 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  53.56 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  54.78 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  53.81 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  53.85 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  54.91 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  52.71 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  54.93 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  53.56 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  54.27 
 
 		 442 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  53.56 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  53.36 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  54.04 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  55.21 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  54.33 
 
 		 432 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  54.27 
 
 		 440 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>