More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0643 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  81.67 
 
 		 432 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 432 aa  858    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  81.44 
 
 		 432 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  79.86 
 
 		 434 aa  687    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  72.56 
 
 		 430 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  72.33 
 
 		 430 aa  625  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  72.56 
 
 		 430 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  70.4 
 
 		 430 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  69.23 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  69.14 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  69.7 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  66.74 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  67.6 
 
 		 441 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  67.37 
 
 		 447 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  66.13 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  67.37 
 
 		 430 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  66.28 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  64.8 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  66.13 
 
 		 431 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  67.13 
 
 		 433 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  66.82 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  66.82 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  66.98 
 
 		 431 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  67.76 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  67.29 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  62.94 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  61.4 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  63.49 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  62.47 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  62.47 
 
 		 434 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  60.75 
 
 		 436 aa  498  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  56.94 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  59.81 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  60.71 
 
 		 437 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  62.53 
 
 		 438 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  57.31 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  55.97 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 437 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  57.11 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  54.33 
 
 		 429 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  54.33 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  54.31 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  53.11 
 
 		 429 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  55.04 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  53.4 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  52.69 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  49.3 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  55.63 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  51.64 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  52.05 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  52.33 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  52.58 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  51.55 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  52.58 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  58.87 
 
 		 436 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  52.33 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  53.52 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  51.67 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  51.41 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  52.97 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  51.17 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  50.47 
 
 		 441 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  53.94 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  51.53 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 440 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  53.41 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  50.86 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  52.13 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  48.68 
 
 		 430 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  51.95 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  48.03 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  52.48 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  51.13 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  50.95 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  52.18 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  50.25 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  48.01 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  47.56 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  46.77 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  52.26 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  48.82 
 
 		 440 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  51.63 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  51.36 
 
 		 441 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  48.03 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>