More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0897 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  79.25 
 
 		 431 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  81.59 
 
 		 444 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  81.35 
 
 		 447 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  79.53 
 
 		 431 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  81.12 
 
 		 441 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  81.4 
 
 		 431 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 431 aa  850    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  69.01 
 
 		 430 aa  591  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  68.14 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  70.16 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  67.91 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  69.07 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  68.07 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  70.93 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  69.07 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  68.84 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  68.68 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  65.73 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  66.74 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  66.98 
 
 		 432 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  68.6 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  66.74 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  70.7 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  66.98 
 
 		 434 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  66.43 
 
 		 430 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  62.79 
 
 		 434 aa  528  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  64.42 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  62.47 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  60.98 
 
 		 436 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  61.77 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  61.54 
 
 		 434 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  62.21 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  60.98 
 
 		 439 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  61.07 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  53.88 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  56 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  61.54 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  55.94 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  52.58 
 
 		 437 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  52.26 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  56.41 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  51.78 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  53.1 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  56.07 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  54.12 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  52.14 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  52.62 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  48.95 
 
 		 448 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  48 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  53.4 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  52.38 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  51.63 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  53.08 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  49.41 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  50.59 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  49.07 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  49.06 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  49.07 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  47.42 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  53.27 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  48.95 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  48.83 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  48.72 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  48.4 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  49.3 
 
 		 440 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  48.36 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  48.96 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  48.96 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  45.9 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  48.95 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  47.65 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  49.54 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  48.36 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  48.36 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>