More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1220 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 437 aa  889    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  60.09 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  60.99 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  56.29 
 
 		 440 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  57.94 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  56.06 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  55.81 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  55.3 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  55.09 
 
 		 436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  54.76 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  58.45 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  54.76 
 
 		 441 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  54.76 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  57.71 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  54.76 
 
 		 441 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  58.45 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  53.79 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  53.47 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  53.92 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  53.69 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  54.63 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  54.06 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  53.7 
 
 		 438 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  58.21 
 
 		 438 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  55.74 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  56.34 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  54.84 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  56.38 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  54.99 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  52.5 
 
 		 436 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  55.4 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  52.45 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  52.45 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  53.15 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  51.72 
 
 		 440 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  53.08 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  55.87 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  55.5 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  54.16 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  50.8 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  52.8 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  53 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  53.5 
 
 		 431 aa  431  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  51.27 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  54.65 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  54.65 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  52.34 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  52.76 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  51.74 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  52.76 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  50.92 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  52.76 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  51.52 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  52.76 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  52.3 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  52.34 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  52.76 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  53.74 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  52.58 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  52.76 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  52.07 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  51.61 
 
 		 440 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  52.22 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  52.29 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  52.07 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  52.58 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  52.91 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  52.57 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  51.48 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  53.79 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  51.84 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  52.3 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  52.75 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  51.86 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  52.33 
 
 		 439 aa  425  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  52.29 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  52.06 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  51.38 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  52.53 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  52.33 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  53.32 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  51.38 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  51.38 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  53.65 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  51.5 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  51.38 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  52.24 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  52.21 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  52.21 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>