More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3704 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  77.44 
 
 		 432 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  77.16 
 
 		 429 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  79.25 
 
 		 429 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  96.27 
 
 		 429 aa  833    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  79.02 
 
 		 436 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 429 aa  865    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  76.51 
 
 		 430 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  67.76 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  51.63 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  56.05 
 
 		 433 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  56.05 
 
 		 433 aa  461  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  52.09 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  51.45 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  54.78 
 
 		 439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  55.76 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  55.4 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  55.37 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  55.45 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  54.67 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  54.67 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  52.96 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  51.88 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  55.15 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  53.99 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  53.27 
 
 		 434 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  54.29 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  53.63 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  54.12 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  54.14 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  53.27 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  53.49 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  51.57 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  53.35 
 
 		 438 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  52.71 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  52.57 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  53.55 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  53.13 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 		 436 aa  431  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  53.4 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  53.16 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 		 442 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  53.36 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  54.99 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  55.42 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  51.75 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  53.87 
 
 		 429 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  54.55 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  50.8 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  53.16 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  54.27 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  52.39 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  52.39 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  53.41 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  52.34 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  54.65 
 
 		 438 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  52.45 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  54.65 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  51.21 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  53.57 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  52.91 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  48.69 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  54.65 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  54.65 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  54.93 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  52.09 
 
 		 435 aa  425  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  53.23 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  53.37 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  53.11 
 
 		 432 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  53.13 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  52.63 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  53.13 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  53.81 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  53.85 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  53.13 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  55.09 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  54.19 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  52.88 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  53.74 
 
 		 447 aa  421  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  54.19 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  53.74 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  54.19 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  52.82 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  53.97 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  48.33 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  54.19 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  51.65 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  53.95 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>