More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0252 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  99.77 
 
 
430 aa  857    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
430 aa  860    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  91.16 
 
 
430 aa  787    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  74.42 
 
 
432 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  74.65 
 
 
434 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  72.56 
 
 
432 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  73.95 
 
 
432 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  72.73 
 
 
430 aa  624  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  69.93 
 
 
431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  70.24 
 
 
431 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  68.14 
 
 
431 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  69.93 
 
 
433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  69.93 
 
 
447 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  68.53 
 
 
441 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  71.12 
 
 
444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  68.37 
 
 
431 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  67.29 
 
 
431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  67.13 
 
 
430 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  64.97 
 
 
431 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  67.29 
 
 
431 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  68.69 
 
 
431 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  67.3 
 
 
445 aa  548  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  66.82 
 
 
431 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  69.03 
 
 
431 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  65.89 
 
 
431 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  61.54 
 
 
434 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  60.84 
 
 
434 aa  519  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  60.84 
 
 
434 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  62.56 
 
 
434 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  60.61 
 
 
434 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  59.58 
 
 
436 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  58.41 
 
 
439 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  55.58 
 
 
431 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  59.29 
 
 
437 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  60.1 
 
 
438 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  55.42 
 
 
446 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 
430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  58.28 
 
 
430 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  52.45 
 
 
437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  52.61 
 
 
429 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  52.13 
 
 
429 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  55.4 
 
 
429 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  50.59 
 
 
432 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  51.54 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  51.18 
 
 
436 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  55.94 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 
429 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  52.84 
 
 
432 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  48.69 
 
 
433 aa  408  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  52.8 
 
 
434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  51.66 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  48.73 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 
431 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  48.48 
 
 
434 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  49.17 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  49.76 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  48.6 
 
 
441 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  50.47 
 
 
436 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  48.27 
 
 
445 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  50.87 
 
 
433 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  48.6 
 
 
441 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  48.6 
 
 
441 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  48.5 
 
 
444 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
438 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  49.41 
 
 
440 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 
440 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  46.84 
 
 
440 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  49.04 
 
 
436 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  46.35 
 
 
430 aa  392  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  48.95 
 
 
430 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  48.83 
 
 
436 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  48.38 
 
 
440 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  48.12 
 
 
448 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  51.77 
 
 
434 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 
435 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  48.61 
 
 
440 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  50.64 
 
 
437 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  46.88 
 
 
440 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  49.54 
 
 
445 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  48.36 
 
 
448 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  49.54 
 
 
445 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  47.81 
 
 
440 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  49.54 
 
 
445 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  47.89 
 
 
441 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  49.54 
 
 
445 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  49.54 
 
 
445 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  47.9 
 
 
441 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  49.54 
 
 
445 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  47.89 
 
 
427 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  48.28 
 
 
442 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  48.51 
 
 
434 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 
447 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 
432 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  48.52 
 
 
438 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  49.32 
 
 
445 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>