More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3799 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  78.37 
 
 		 432 aa  673    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  77.86 
 
 		 429 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  80.19 
 
 		 429 aa  715    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 429 aa  864    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  96.27 
 
 		 429 aa  833    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  79.25 
 
 		 436 aa  706    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  76.98 
 
 		 430 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  68.22 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 		 437 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  52.22 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  51.69 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  51.74 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  55.48 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  54.14 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  55.37 
 
 		 433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  55.37 
 
 		 433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  56 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  55.82 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  55.63 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  54.55 
 
 		 439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  55.76 
 
 		 440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  54.1 
 
 		 434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  54.44 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  54.82 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  51.64 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  54.14 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  53.5 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  53.5 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  53.86 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  53.04 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  54.15 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  51.92 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  54.35 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  50.92 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  52.8 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  53.41 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  55.9 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  51.18 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  52.39 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  53.47 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  51.75 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  53.41 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  53.32 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  53.49 
 
 		 440 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  53.88 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  52.39 
 
 		 439 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  53.35 
 
 		 438 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  52.68 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  53.92 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  55.16 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  54.11 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  52.93 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  53.61 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  52.68 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  54.27 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  48.69 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  54.73 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  52.12 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  52.56 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  53.83 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  53.13 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  52.33 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  55.58 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  52.67 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  53 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  50.59 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 429 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  53.97 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1713  histidinol dehydrogenase  55.06 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.665039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  53.83 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  53.65 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  53.61 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  52.36 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  52.58 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  48.67 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  53.72 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  52.26 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  53.72 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  52.11 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  53.04 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  53.95 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>