More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2882 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  886    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  61.07 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  59.26 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  59.08 
 
 		 434 aa  528  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  60.4 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  58.43 
 
 		 429 aa  481  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  58.67 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  58.35 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  60.87 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  60.05 
 
 		 429 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  61.06 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  59.45 
 
 		 429 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 429 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 429 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  57.11 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  53.94 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  57.39 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  52.72 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  56.14 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  55.81 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  52.56 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  51.97 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  52.48 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  51.51 
 
 		 436 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  52.09 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  52.9 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  52.88 
 
 		 436 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  53.77 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  52.96 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  52.86 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  51.27 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  54.16 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  53.15 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  53.49 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  54.41 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  52.14 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1332  histidinol dehydrogenase  51.97 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  53.54 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  51 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  51.31 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  51.18 
 
 		 427 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  51.75 
 
 		 441 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  53.12 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  50.38 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  51.49 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  48.8 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  48.43 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  47.73 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  54.29 
 
 		 443 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  50.88 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  50.75 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  52.55 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  46.95 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 		 434 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  50.49 
 
 		 434 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  47.6 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  47.98 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  50.13 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  50.75 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  47.23 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  49.16 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  46.04 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  50.38 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  50.75 
 
 		 430 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  47.96 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  50.25 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2013  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  49.75 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  46.75 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  48.68 
 
 		 440 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  44.84 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  47.86 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  48.22 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0554  histidinol dehydrogenase  49.62 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.677431  normal  0.387013 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  45.3 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  48.22 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  48.32 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  51.24 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  48.92 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  44.95 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  46.86 
 
 		 436 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  49.05 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  47.48 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  48.9 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  46.04 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  49.26 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  47.95 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  47.38 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>