More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2355 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
430 aa  880    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  61.74 
 
 
432 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  58.91 
 
 
426 aa  508  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  61.54 
 
 
439 aa  488  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  58.08 
 
 
432 aa  488  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  55.07 
 
 
434 aa  478  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  53.85 
 
 
436 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  53.61 
 
 
429 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  54.44 
 
 
424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  56 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  51.63 
 
 
429 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  54.67 
 
 
427 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  52.57 
 
 
437 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  54.94 
 
 
429 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  58.35 
 
 
435 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  54.92 
 
 
429 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  54.68 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  54.92 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  51.98 
 
 
429 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  54.68 
 
 
429 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 
429 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  54.94 
 
 
429 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  54.68 
 
 
429 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 
424 aa  457  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  55.93 
 
 
424 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  54.55 
 
 
454 aa  455  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  53.13 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  54.61 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 
422 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 
429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  54.55 
 
 
431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  51.17 
 
 
428 aa  448  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  51.67 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  53.02 
 
 
432 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  52.66 
 
 
430 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  54.8 
 
 
433 aa  438  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  52.66 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  53.28 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  54.41 
 
 
427 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  54.04 
 
 
436 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  52.88 
 
 
436 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  51.62 
 
 
457 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  54.2 
 
 
445 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1370  histidinol dehydrogenase  51.3 
 
 
436 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304099  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  51.18 
 
 
434 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  50.74 
 
 
430 aa  420  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  52.52 
 
 
434 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  52 
 
 
427 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  49.29 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 
430 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  53 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  48.13 
 
 
446 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
431 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 
440 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
425 aa  414  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  49.07 
 
 
437 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  50.48 
 
 
436 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
449 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  51.21 
 
 
437 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2013  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
444 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
449 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
427 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  47.2 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 
434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  47.43 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
433 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  46.94 
 
 
428 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  48.56 
 
 
428 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 
436 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  48.72 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
432 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  47.09 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  51.49 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  47.74 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  51.21 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  49.16 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  47.14 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  47.98 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  48.72 
 
 
426 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  49.13 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  46.85 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  51.07 
 
 
438 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  49.13 
 
 
433 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
431 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  46.14 
 
 
440 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 
439 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  49.05 
 
 
431 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 
439 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>