More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2785 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
437 aa  881    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  59.26 
 
 
435 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  59.11 
 
 
427 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  59.25 
 
 
424 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  58.31 
 
 
422 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  52.57 
 
 
430 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 
429 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  54.04 
 
 
434 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  56.49 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  56.19 
 
 
429 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  56.19 
 
 
429 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  56.19 
 
 
429 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  55.95 
 
 
429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  56.19 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 
429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  52.06 
 
 
432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  53.62 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  53.7 
 
 
428 aa  448  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 
429 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  55.27 
 
 
429 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 
429 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  56.61 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  52.3 
 
 
426 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  52.67 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 
436 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  52.29 
 
 
430 aa  435  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  51.39 
 
 
430 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  52.53 
 
 
428 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  52.85 
 
 
434 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  54.02 
 
 
424 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
429 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
431 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  53.3 
 
 
457 aa  426  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  51.5 
 
 
431 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
428 aa  425  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  50.87 
 
 
434 aa  421  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  48.96 
 
 
436 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  52.13 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  51.92 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  52.42 
 
 
439 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  48.16 
 
 
434 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  50.72 
 
 
430 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 
428 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  52.04 
 
 
426 aa  409  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  51.45 
 
 
428 aa  411  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  48.91 
 
 
425 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  49.13 
 
 
454 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 
427 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  48.5 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  51.39 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1332  histidinol dehydrogenase  53.54 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  47.91 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  51.79 
 
 
452 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  46.99 
 
 
436 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  49.26 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  50.13 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  52.37 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  47.79 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  47.33 
 
 
430 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  48.8 
 
 
433 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  50.64 
 
 
430 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0554  histidinol dehydrogenase  50.37 
 
 
443 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.677431  normal  0.387013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  51.13 
 
 
432 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  50.64 
 
 
430 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  47.1 
 
 
430 aa  386  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  44.08 
 
 
446 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  50.5 
 
 
431 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  46.59 
 
 
440 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0763  histidinol dehydrogenase  48.63 
 
 
436 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  47.06 
 
 
434 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  48.27 
 
 
436 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  46.82 
 
 
440 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  50.37 
 
 
440 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
431 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
432 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 
430 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  51.02 
 
 
431 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  49.12 
 
 
436 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  49 
 
 
436 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  45.81 
 
 
431 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  48.78 
 
 
434 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  47.71 
 
 
431 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  45.98 
 
 
441 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  46.08 
 
 
432 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  46.59 
 
 
440 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  46.8 
 
 
444 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  44.71 
 
 
442 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  50.64 
 
 
430 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 
430 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 
438 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  48.75 
 
 
436 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 
438 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  45.81 
 
 
434 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  46.24 
 
 
445 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  51.8 
 
 
431 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>