More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0973 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  87.33 
 
 		 436 aa  778    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  96.83 
 
 		 441 aa  870    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  98.19 
 
 		 441 aa  889    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  98.41 
 
 		 441 aa  891    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  88.58 
 
 		 448 aa  805    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  89.5 
 
 		 448 aa  808    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 441 aa  903    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  90.7 
 
 		 441 aa  821    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  87.1 
 
 		 436 aa  783    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  73.83 
 
 		 438 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  87.02 
 
 		 440 aa  780    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  87.02 
 
 		 440 aa  780    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  74.3 
 
 		 434 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  75.76 
 
 		 432 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  69.39 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  69 
 
 		 436 aa  611  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  70.33 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  67.37 
 
 		 433 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  69.16 
 
 		 440 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  68.36 
 
 		 435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  67.99 
 
 		 432 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  67.52 
 
 		 433 aa  592  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  70.4 
 
 		 434 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  66.36 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  65.75 
 
 		 438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  66.05 
 
 		 435 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  66.59 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  64.53 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  64.53 
 
 		 439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  67.21 
 
 		 444 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  64.53 
 
 		 439 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  66.9 
 
 		 445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  64.12 
 
 		 440 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  64.46 
 
 		 447 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  66.28 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  66.28 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  66.74 
 
 		 440 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 		 442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  65.83 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  66.67 
 
 		 445 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  66.28 
 
 		 440 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  65.83 
 
 		 438 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  65.83 
 
 		 442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  66.2 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  66.2 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  65.37 
 
 		 442 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  66.2 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  63.01 
 
 		 440 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  66.2 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  66.2 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  63.36 
 
 		 447 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  65.97 
 
 		 445 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  64.35 
 
 		 438 aa  558  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  65.97 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  64.53 
 
 		 438 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  64.4 
 
 		 439 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  64.35 
 
 		 447 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1713  histidinol dehydrogenase  68.22 
 
 		 434 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.665039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  64.22 
 
 		 438 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  64.22 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  63.57 
 
 		 447 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  62.68 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  62.68 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  62.06 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  60.8 
 
 		 430 aa  521  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  61.59 
 
 		 432 aa  519  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  54.76 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  58.35 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  55.53 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  54.82 
 
 		 436 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  53.88 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  54.35 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  53.63 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  55.06 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  53.86 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  53.83 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  51.62 
 
 		 436 aa  435  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  56.62 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  52.55 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  52.82 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  53.18 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  52.2 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  52.2 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  48.69 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  54.79 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  51.93 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  52.58 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  53.65 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  48.47 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  53.02 
 
 		 422 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  49.51 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>