More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3512 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  82.83 
 
 
431 aa  688    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  79.81 
 
 
431 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  81.21 
 
 
431 aa  686    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  81.21 
 
 
431 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  80.05 
 
 
431 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
431 aa  851    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  69.46 
 
 
431 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  71.56 
 
 
447 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  70.23 
 
 
431 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  69.07 
 
 
431 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  69.46 
 
 
441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  67.29 
 
 
430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  69.23 
 
 
433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  66.9 
 
 
430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  68.37 
 
 
434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  66.9 
 
 
430 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  67.67 
 
 
431 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  67.06 
 
 
430 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  69.46 
 
 
444 aa  565  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  69.16 
 
 
445 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  69.77 
 
 
431 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  68.53 
 
 
430 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  66.28 
 
 
432 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  66.59 
 
 
432 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  65.65 
 
 
432 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  64.17 
 
 
434 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  63.79 
 
 
436 aa  521  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  63.47 
 
 
434 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  62.24 
 
 
434 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  63.72 
 
 
437 aa  512  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  63.47 
 
 
434 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  65.58 
 
 
434 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  61.27 
 
 
439 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  55.81 
 
 
431 aa  485  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  62.32 
 
 
438 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  57.41 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  52.67 
 
 
437 aa  435  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  53.26 
 
 
429 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  60.98 
 
 
436 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
432 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  52.34 
 
 
433 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  52.09 
 
 
433 aa  428  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  53.02 
 
 
436 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  58.51 
 
 
430 aa  428  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  52.57 
 
 
448 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 
429 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
433 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  56.84 
 
 
429 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 
434 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 
429 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  53.02 
 
 
429 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  52.34 
 
 
448 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  52.08 
 
 
444 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  52.08 
 
 
445 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  51.17 
 
 
436 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  53.95 
 
 
432 aa  418  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  53.49 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 
441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  51.17 
 
 
441 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  52.9 
 
 
431 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 
441 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  51.52 
 
 
440 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  51.98 
 
 
435 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 
435 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 
436 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 
441 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  53.72 
 
 
434 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
440 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 
439 aa  408  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 
438 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  51.52 
 
 
440 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 
438 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  50.69 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  53.02 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  53.02 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  51.63 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  51.64 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  49.31 
 
 
440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  50.69 
 
 
438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 
442 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  51.04 
 
 
440 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
440 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
438 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
440 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 
445 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>