More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0521 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 431 aa  856    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  68.45 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  68.21 
 
 		 431 aa  581  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  67.44 
 
 		 430 aa  581  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  68.68 
 
 		 431 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  65.57 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  66.98 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  64.97 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  67.67 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 		 445 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  64.73 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  68.14 
 
 		 441 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  68.14 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  66.36 
 
 		 432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  66.13 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  66.13 
 
 		 432 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  68.6 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  66.43 
 
 		 439 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  66.82 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  66.05 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  67.21 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  67.98 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  66.74 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  64.8 
 
 		 436 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  65.58 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  66.05 
 
 		 434 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  63.72 
 
 		 434 aa  539  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  64.88 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  64.88 
 
 		 434 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  67.21 
 
 		 438 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  62.06 
 
 		 437 aa  505  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  63.72 
 
 		 430 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 437 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  61.07 
 
 		 430 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  55.87 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  56.1 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  57.28 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  54.8 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  53.63 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  53.86 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  60.42 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  56 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  53.86 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  60.61 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  55.16 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  53.63 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  54.97 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  56.34 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  53.01 
 
 		 440 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 		 441 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  54.06 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  53.99 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  53.95 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 		 441 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  52.46 
 
 		 448 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 		 441 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  52.22 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  52.93 
 
 		 441 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  51.99 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  53.86 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  52.4 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  53.13 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  52.31 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  52.42 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 		 438 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  52.31 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  52.52 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  55.4 
 
 		 431 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  52.31 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  53.36 
 
 		 438 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  52.9 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 		 436 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  51.06 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  53.35 
 
 		 445 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  52.11 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  53.13 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  51.99 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  52.9 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  53.13 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  52.67 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  52.74 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  52.74 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  52.74 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  51.95 
 
 		 440 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  52.74 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  52.74 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  52.74 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  52.74 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>