More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0208 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  79.86 
 
 		 432 aa  687    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  82.79 
 
 		 432 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  82.09 
 
 		 432 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 434 aa  855    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  74.42 
 
 		 430 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  74.65 
 
 		 430 aa  632  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  74.42 
 
 		 430 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  71.33 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  68.45 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  68.37 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  67.6 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  69.23 
 
 		 447 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  69.23 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  68.37 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  67.83 
 
 		 441 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  66.98 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  66.43 
 
 		 445 aa  557  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  67.91 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  67.91 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  66.28 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  66.67 
 
 		 430 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  67.21 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  66.13 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  66.98 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  64.88 
 
 		 434 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  62.56 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  60.7 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  62.04 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  62.04 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  61.56 
 
 		 439 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  60.28 
 
 		 436 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  60.56 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  62.26 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  55.76 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  57.18 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  57.01 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  55.87 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  52.71 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  57.58 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  53.4 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  56.78 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  61.7 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  51.52 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  52.55 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  52.52 
 
 		 430 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  52.22 
 
 		 448 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  51.99 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  53.6 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  54.82 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  51.52 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  51.63 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  52.2 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  52.2 
 
 		 440 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  51.62 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  51.85 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  52.57 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  54.23 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  51.75 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 		 438 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  52.83 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  49.19 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  50.71 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  51.86 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  49.63 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  51.36 
 
 		 441 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  51.85 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  50.11 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  50.34 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  50.34 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  50.34 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  50.34 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  50.34 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  51.62 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  50.34 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  50.11 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  49.54 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  50.8 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>