More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2026 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  846    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  72.43 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  66.43 
 
 		 429 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  54.42 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  61.07 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  55.97 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  61.31 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  55.37 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  57.01 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  58.45 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  58.31 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  57.81 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  56.57 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  58.19 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  57.41 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  57.51 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  58.18 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  53.95 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  56.1 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  55.74 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  55.5 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  56.1 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  55.94 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  56.07 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  56.02 
 
 		 431 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  57.48 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  55.79 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  59.03 
 
 		 431 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  56.25 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  54.44 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  54.67 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  57.77 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  55.94 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  55.32 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  54.44 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  52.1 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  48.84 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  48.72 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  47.91 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  47.44 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  46.87 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  46.39 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  46.87 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  46.38 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  47.67 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  49.19 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  43.72 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  46.4 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  47.32 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  45.45 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  46.99 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  47.67 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  46.77 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  47.44 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  46.87 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  45.71 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  47.91 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  45.58 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  47.45 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  45.12 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  44.72 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  47.21 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  46.79 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  47.2 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  46.67 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  46.05 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  46.05 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  44.21 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  44.89 
 
 		 430 aa  364  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  47.56 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 445 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 438 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  46.3 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  46.56 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  45.96 
 
 		 439 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  46.79 
 
 		 438 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  47.02 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  46.79 
 
 		 438 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  46.05 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  45.94 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1713  histidinol dehydrogenase  48.37 
 
 		 434 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.665039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  48.71 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  46.33 
 
 		 445 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>