More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0286 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  82.28 
 
 		 431 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  93.94 
 
 		 444 aa  762    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  82.75 
 
 		 447 aa  686    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  81.44 
 
 		 431 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  83.68 
 
 		 441 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 431 aa  846    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  81.4 
 
 		 431 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  71.1 
 
 		 433 aa  596  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  71.19 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  70.24 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  70.24 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  70.93 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  69.14 
 
 		 432 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  69.61 
 
 		 432 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  68.76 
 
 		 445 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  70.23 
 
 		 431 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  69.61 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  70 
 
 		 431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  68.37 
 
 		 434 aa  569  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  68.21 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  68.53 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  70.7 
 
 		 431 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  69.3 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  70.23 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  66.67 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  65.58 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  60.93 
 
 		 434 aa  504  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  59.58 
 
 		 436 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  60.37 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  60.37 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  62.21 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  60.98 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  60.14 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  54.59 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  58.74 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  56.64 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  61.79 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  52.58 
 
 		 437 aa  428  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  54.82 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  54.44 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  52.82 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  52.82 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  56.07 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  52.82 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  50.59 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  51.62 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  51.51 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  52.82 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  51.85 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  51.64 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  52.82 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  50.81 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  50.81 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  51.04 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  53.81 
 
 		 431 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  51.74 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  50.81 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  50.81 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  51.03 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  50.81 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  49.05 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  49.41 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  48.72 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  48.12 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  48.7 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  53.02 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  48.84 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  48.83 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  49.19 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  48.72 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  48.84 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>