More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0239 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  82.79 
 
 
434 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  96.3 
 
 
432 aa  828    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  81.67 
 
 
432 aa  712    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
432 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  73.95 
 
 
430 aa  626  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  73.95 
 
 
430 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  73.72 
 
 
430 aa  623  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  69.93 
 
 
430 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  69.61 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  68.07 
 
 
431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  69.46 
 
 
444 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  68.07 
 
 
447 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  67.6 
 
 
441 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  66.74 
 
 
431 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  68.14 
 
 
431 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  67.91 
 
 
431 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  66.2 
 
 
445 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  66.82 
 
 
431 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  66.13 
 
 
431 aa  544  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  66.59 
 
 
431 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  65.97 
 
 
433 aa  534  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  66.2 
 
 
430 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  66.36 
 
 
431 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  67.21 
 
 
431 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  63.72 
 
 
434 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  66.36 
 
 
431 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  62.24 
 
 
434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  61.31 
 
 
434 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  61.54 
 
 
434 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  60.51 
 
 
436 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  60.51 
 
 
439 aa  491  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  63.64 
 
 
438 aa  492  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  62.25 
 
 
434 aa  490  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  55.29 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  58.35 
 
 
437 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  54.48 
 
 
446 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  53.76 
 
 
429 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  56.64 
 
 
430 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  55.5 
 
 
430 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  53.79 
 
 
437 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  52.58 
 
 
429 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  56.56 
 
 
429 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  55.04 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  53.4 
 
 
429 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  56.47 
 
 
431 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  52.91 
 
 
436 aa  411  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  51.88 
 
 
436 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  51.88 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  50.47 
 
 
434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  51.64 
 
 
448 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  50.84 
 
 
432 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  52.71 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  52.46 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  57.4 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  49.3 
 
 
440 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  52.61 
 
 
433 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  50.94 
 
 
441 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  52.4 
 
 
441 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  50.7 
 
 
436 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  52.82 
 
 
430 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
433 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  52.4 
 
 
441 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 
440 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  51.92 
 
 
441 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  51.92 
 
 
441 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  50.98 
 
 
429 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 
454 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 
440 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 
439 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  51.19 
 
 
435 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  51.06 
 
 
433 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  52.41 
 
 
434 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  48.35 
 
 
440 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  51.06 
 
 
433 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 
435 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 
440 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 
439 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 
427 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 
439 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  51.55 
 
 
436 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  47.44 
 
 
440 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  50.95 
 
 
422 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  47.76 
 
 
436 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  51.88 
 
 
439 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  51.98 
 
 
424 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  50.48 
 
 
430 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  48.26 
 
 
429 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  50.25 
 
 
429 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  48.6 
 
 
442 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  48.37 
 
 
445 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
429 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
429 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  48.37 
 
 
444 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  51.13 
 
 
441 aa  381  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  50.25 
 
 
429 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
437 aa  378  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  49.87 
 
 
434 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  48.02 
 
 
438 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>