More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4350 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  81.22 
 
 		 444 aa  682    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  81.35 
 
 		 431 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 447 aa  885    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  82.13 
 
 		 431 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  91.61 
 
 		 441 aa  794    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  82.75 
 
 		 431 aa  705    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  87.24 
 
 		 431 aa  748    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  71.63 
 
 		 445 aa  610  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  71.56 
 
 		 431 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  69.93 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  71.16 
 
 		 433 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  69.93 
 
 		 430 aa  594  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  69.23 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  69.21 
 
 		 430 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  69.46 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  69 
 
 		 431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  68.07 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  68.07 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  67.13 
 
 		 430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  68.14 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  69.23 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  67.37 
 
 		 432 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  68.53 
 
 		 431 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  69.46 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  66.28 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  66.36 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  61.4 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  61.63 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  61.21 
 
 		 436 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  63.85 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  60.47 
 
 		 434 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  60.7 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  60 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  60 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  53.65 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  57.01 
 
 		 446 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  59.21 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  58.18 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  52.91 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  61.79 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  57.51 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  52.34 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  51.88 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  52.11 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  51.86 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  51.85 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  53.81 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  50.81 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  50.92 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  49.76 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 433 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  50.81 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  50.69 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  51.04 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  51.97 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  53.16 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  50.8 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  51.28 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 433 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  50.58 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  52.22 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  52.09 
 
 		 433 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  51.76 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  48.97 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  50.47 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  53.52 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>