More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0247 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  81.59 
 
 		 431 aa  698    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 444 aa  877    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  81.22 
 
 		 447 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  81.12 
 
 		 431 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  81.59 
 
 		 431 aa  690    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  82.64 
 
 		 441 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  93.94 
 
 		 431 aa  788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  72.08 
 
 		 430 aa  594  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  71.12 
 
 		 430 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  71.12 
 
 		 430 aa  591  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  71.1 
 
 		 433 aa  588  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  69.23 
 
 		 434 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  69.7 
 
 		 432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  68.53 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  69.7 
 
 		 432 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  69.46 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  69.46 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  69.7 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  68.6 
 
 		 431 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  67.83 
 
 		 430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  69.23 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  68.76 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  69.93 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  69.93 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  67.13 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  65.81 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  61.16 
 
 		 434 aa  504  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  61.54 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  61.54 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  60.51 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  61.31 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  62.44 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  59.58 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  56 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  59.67 
 
 		 438 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  55.53 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  56.41 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  61.7 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  54.44 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  51.53 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  51.06 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  53.04 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  53.05 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  55.16 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  55.63 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  51.05 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  53.68 
 
 		 431 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  51.64 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  50.59 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  48.03 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  51.41 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  50.82 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 440 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  48.71 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  50.11 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  48.47 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  50.69 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 438 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  51.86 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  48.92 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  49.13 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  53.02 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  48.59 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  49.18 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  51.75 
 
 		 436 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 442 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  48.39 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  49.19 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  49.19 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  48.88 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  48.46 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  46.82 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  49.26 
 
 		 429 aa  378  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  49.65 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>