More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3588 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 446 aa  885    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  58.64 
 
 		 430 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  56.21 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  57.18 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  55.42 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  55.42 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  57.85 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  57.31 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  57.78 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  59.71 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  55.66 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  56.6 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  57.28 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  56.13 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  57.65 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  56.13 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  56 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  56.07 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  54.57 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  53.77 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  56.41 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  56.41 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  58.28 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  57.01 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  54.95 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  56 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  56.31 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  54.48 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2776  histidinol dehydrogenase  60.47 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1939  Histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0835153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  54.82 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  52.71 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  55.53 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2026  histidinol dehydrogenase  55.71 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  56.34 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  55.98 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4417  histidinol dehydrogenase  54.59 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  48.83 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  47.89 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  52.93 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  48.6 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  47.66 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  45.56 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  48.95 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  47.45 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  48.13 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  48.06 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  47.32 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  46.5 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  50.12 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  46.73 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  50.59 
 
 		 431 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  48.14 
 
 		 429 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  46.74 
 
 		 433 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  49.87 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  46.51 
 
 		 441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  47.86 
 
 		 439 aa  362  8e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  44.78 
 
 		 440 aa  362  9e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  46.15 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  48.05 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  45.92 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  46.39 
 
 		 436 aa  359  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  46.28 
 
 		 435 aa  358  8e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  46.06 
 
 		 440 aa  358  9e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  45.69 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  45.69 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  45.45 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  48.15 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  46.88 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  46.84 
 
 		 439 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  48.93 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 		 422 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  49.37 
 
 		 426 aa  356  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  47.69 
 
 		 445 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  45.09 
 
 		 448 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  47.58 
 
 		 447 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  48.15 
 
 		 440 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  47.64 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  49.76 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  47.88 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  46.96 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  45.71 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  46.51 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  49.38 
 
 		 441 aa  352  8e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  47.33 
 
 		 439 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  47.61 
 
 		 437 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  46.19 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  44.52 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  45.34 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  46.53 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  45.08 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  47.71 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  47.71 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  51.11 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  46.29 
 
 		 426 aa  348  2e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>