More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0513 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  71.43 
 
 
428 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0554  histidinol dehydrogenase  74 
 
 
443 aa  651    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.677431  normal  0.387013 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  75.82 
 
 
428 aa  671    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  877    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  76.94 
 
 
427 aa  681    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  71.6 
 
 
428 aa  624  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  69.32 
 
 
430 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  51.79 
 
 
422 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  52.87 
 
 
424 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  48.24 
 
 
428 aa  428  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0666  histidinol dehydrogenase  53.4 
 
 
443 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  48.11 
 
 
429 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  48.11 
 
 
429 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  48.66 
 
 
429 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  46.34 
 
 
427 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  48.66 
 
 
429 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  48.16 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  48.16 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  44.24 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  47.88 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  48.16 
 
 
429 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  47.91 
 
 
429 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  48.16 
 
 
429 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  52.44 
 
 
432 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  48.46 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  47.74 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  47.76 
 
 
446 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  48.68 
 
 
430 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  49.5 
 
 
454 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  48.29 
 
 
427 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
431 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  48.51 
 
 
441 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  46.37 
 
 
432 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 
436 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  50.38 
 
 
435 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  47.6 
 
 
449 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  46.54 
 
 
433 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 
434 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  47.36 
 
 
449 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  45.65 
 
 
425 aa  389  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  48.39 
 
 
429 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
430 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  49.04 
 
 
439 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  47.99 
 
 
440 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  48.39 
 
 
429 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  47.39 
 
 
429 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  47.37 
 
 
426 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  47.43 
 
 
431 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  47.37 
 
 
439 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  47.65 
 
 
436 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  44.47 
 
 
434 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  49.14 
 
 
429 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  46.68 
 
 
428 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  47.13 
 
 
440 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  45.62 
 
 
440 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 
452 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  45.85 
 
 
436 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  47.76 
 
 
436 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  48.19 
 
 
430 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  47.51 
 
 
436 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  46.34 
 
 
457 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  44.7 
 
 
433 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  47.87 
 
 
433 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  47 
 
 
424 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  47.13 
 
 
441 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  47.13 
 
 
440 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  47.03 
 
 
434 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  44.76 
 
 
434 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  48.04 
 
 
436 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  46.88 
 
 
441 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  46.25 
 
 
426 aa  371  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  43.19 
 
 
433 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  43.98 
 
 
432 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  46.12 
 
 
444 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  44.61 
 
 
428 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  47.98 
 
 
426 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  48.93 
 
 
447 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  46.89 
 
 
439 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  44.52 
 
 
435 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  45.96 
 
 
438 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  45.48 
 
 
423 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  46.5 
 
 
439 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  45.73 
 
 
432 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  48.91 
 
 
447 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  44.47 
 
 
427 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  47.39 
 
 
441 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  46.9 
 
 
447 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  47.39 
 
 
441 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  44.44 
 
 
448 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  43.59 
 
 
448 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  44.36 
 
 
428 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  46.02 
 
 
441 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  46.84 
 
 
447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  45.3 
 
 
428 aa  362  8e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 
438 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  44.15 
 
 
427 aa  361  1e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  44.87 
 
 
445 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  44.77 
 
 
445 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>